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對(duì)馬拉二胡

至尊木蟲 (職業(yè)作家)

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[求助] MS中 castep 優(yōu)化結(jié)構(gòu)出現(xiàn)以下錯(cuò)誤，請(qǐng)問怎么解決？已有3人參與

剛點(diǎn)Run，就出現(xiàn)了

2014/02/28@11:38:47  [26XS0] - 2 CASTEP GeomOpt ERROR The file 2_1.param is either not readable or missing
2014/02/28@11:38:58  [26XS0] - 2 CASTEP GeomOpt ERROR Error on Job Complete. Results file is invalid.
2014/02/28@11:38:59  [26XS0] - 2 CASTEP GeomOpt ERROR Files not removed from server due to previous errors.
2014/02/28@11:38:59  [26XS0] - 2 CASTEP GeomOpt WARN As instructed, files have been left on remote server, these may need to be manually archived.

這是怎么回事��？？

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1樓 2014-01-02 11:49:16

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【答案】應(yīng)助回帖

今天也遇見了這個(gè)問題，仔細(xì)看了下CASTEP的官方文檔，（https://www.tcm.phy.cam.ac.uk/ca ... lone.htm#generation）程序運(yùn)行的命令： RunCASTEP.sh [-h] [-np number of cores] [-nt number of threads] [-q queue name] seedname (Linux)
注意里面的seedname 是不能加后綴的。去掉后綴就可以正常運(yùn)行了。

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10樓2020-07-05 14:59:06

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【答案】應(yīng)助回帖

★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sunyang1988: 金幣+1, 謝謝交流 2014-01-03 10:02:41

從錯(cuò)誤提示中可以看出提示的都是文件不可讀，丟失。所以本人感覺是MS在安裝的時(shí)候出錯(cuò)，建議徹底清空在重新安裝一次，希望能夠有幫助

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2樓2014-01-02 15:07:35

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對(duì)馬拉二胡

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2樓: Originally posted by 零下1℃ at 2014-01-02 15:07:35
從錯(cuò)誤提示中可以看出提示的都是文件不可讀，丟失。所以本人感覺是MS在安裝的時(shí)候出錯(cuò)，建議徹底清空在重新安裝一次，希望能夠有幫助

今天我把截?cái)嗄苷{(diào)大了做收斂性測試發(fā)現(xiàn)可以運(yùn)行，但到中途又出現(xiàn)以下錯(cuò)誤，忘賜教。
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
|                                                    Memory       Disk |
| Model and support data                            920.3 MB    101.2 MB |
| Electronic energy minimisation requirements       682.0 MB    455.1 MB |
|                                              ----------------------------- |
| Approx. total storage required per node          1602.3 MB    556.4 MB |
|                                                                            |
| Requirements will fluctuate during execution and may exceed these estimates |
+-----------------------------------------------------------------------------+
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
SCF loop    Energy                         Energy gain    Timer <-- SCF
                                             per atom       (sec) <-- SCF
------------------------------------------------------------------------ <-- SCF
Initial  -3.68233747E+003                                     541.08  <-- SCF
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
Trapped SIGINT or SIGTERM. Exiting...
MPI Application rank 0 killed before MPI_Finalize() with signal 9

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3樓2014-01-03 10:18:51

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3樓: Originally posted by 對(duì)馬拉二胡 at 2014-01-03 10:18:51
今天我把截?cái)嗄苷{(diào)大了做收斂性測試發(fā)現(xiàn)可以運(yùn)行，但到中途又出現(xiàn)以下錯(cuò)誤，忘賜教。
+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER NODE -----------------+
| ...

LZ在調(diào)大截?cái)嗄苓M(jìn)行收斂性計(jì)算的時(shí)候，必然會(huì)使得計(jì)算所需的內(nèi)存增大。從錯(cuò)誤提示可以看出，LZ所使用的計(jì)算機(jī)性能遠(yuǎn)不能滿足LZ計(jì)算的需要。你這次的錯(cuò)誤源于你的硬件問題。例如：所需內(nèi)存920.3MB，而DISK（硬盤）能夠提供的是101.2MB。希望能夠給你帶來幫助。

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4樓2014-01-03 10:24:58

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4樓: Originally posted by 零下1℃ at 2014-01-03 10:24:58
LZ在調(diào)大截?cái)嗄苓M(jìn)行收斂性計(jì)算的時(shí)候，必然會(huì)使得計(jì)算所需的內(nèi)存增大。從錯(cuò)誤提示可以看出，LZ所使用的計(jì)算機(jī)性能遠(yuǎn)不能滿足LZ計(jì)算的需要。你這次的錯(cuò)誤源于你的硬件問題。例如：所需內(nèi)存920.3MB，而DISK（硬盤）能 ...

非常感謝，但是我用的服務(wù)器內(nèi)存是8個(gè)G的，為什么會(huì)這樣呢？

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5樓2014-01-03 10:37:46

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sunyang1988: 金幣+2, 謝謝交流 2014-01-03 21:57:47

引用回帖:

5樓: Originally posted by 對(duì)馬拉二胡 at 2014-01-03 10:37:46
非常感謝，但是我用的服務(wù)器內(nèi)存是8個(gè)G的，為什么會(huì)這樣呢？...

這個(gè)我還真是不知道為什么，我也只能從給出的錯(cuò)誤提示中做出判斷。不過我建議樓主，截?cái)嗄芙档�，原子個(gè)數(shù)降低，算一個(gè)小一點(diǎn)的體系看看怎么樣，我們一般在剛開始驗(yàn)證計(jì)算的時(shí)候，是不應(yīng)該做特別大的精度高的計(jì)算，LZ可以算小的試試再說。

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6樓2014-01-03 10:55:28

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★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sunyang1988: 金幣+1, 謝謝交流 2014-01-03 21:57:51

你在計(jì)算的時(shí)候把 memory選中試一下

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7樓2014-01-03 13:18:49

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6樓: Originally posted by 零下1℃ at 2014-01-03 10:55:28
這個(gè)我還真是不知道為什么，我也只能從給出的錯(cuò)誤提示中做出判斷。不過我建議樓主，截?cái)嗄芙档停觽€(gè)數(shù)降低，算一個(gè)小一點(diǎn)的體系看看怎么樣，我們一般在剛開始驗(yàn)證計(jì)算的時(shí)候，是不應(yīng)該做特別大的精度高的計(jì)算， ...

謝謝指點(diǎn)，我想應(yīng)該是內(nèi)存不夠的原因。

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8樓2014-01-04 08:42:10

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7樓: Originally posted by wfbgc at 2014-01-03 13:18:49
你在計(jì)算的時(shí)候把 memory選中試一下

我沒有找到memory 這個(gè)選項(xiàng)啊。用的MS5.0。能告訴一下在哪里不？

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9樓2014-01-04 08:44:21

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