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tdairy09金蟲 (正式寫手)
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[求助]
怎么才能從一個(gè)基因組序列中,把我想要的x到y(tǒng)位點(diǎn)之間的序列一下子就弄到? 已有1人參與
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| 怎么才能從一個(gè)基因組序列中,把我想要的x到y(tǒng)位點(diǎn)之間的序列一下子就弄到? 比如我的基因組是2M，我想要620000到630000之間的序列，多謝！ |
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5樓2014-01-10 19:02:20
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| 之前做編碼區(qū)預(yù)測時(shí)弄過，先下載FASTA格式的基因序列，用MATLAB編程根據(jù)CDS.txt文件里指定的每個(gè)編碼區(qū)的起止堿基號(hào)，從基因組序列中把需要的序列截取出來另存。這樣一次處理上千的序列都沒問題。 |
11樓2014-01-10 23:51:44
【答案】應(yīng)助回帖
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/3894097 如果你的菌全基因測序，參考一下這個(gè)鏈接，這是其他菌的一個(gè)基因在全基因組的位置 |
12樓2014-01-11 08:06:26
lcat
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tdairy0914樓2014-01-13 06:51:56
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2樓2014-01-10 09:40:26
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3樓2014-01-10 18:09:32
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7樓2014-01-10 20:44:58
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8樓2014-01-10 21:07:09
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9樓2014-01-10 21:07:34
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