躍龍門(mén)的魚(yú)

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請(qǐng)問(wèn)各位高手在高斯09中優(yōu)化單個(gè)分子時(shí)如何把一部分的參數(shù)固定了，優(yōu)化其他部分，也就是建一個(gè)剛性結(jié)構(gòu)，在高斯中如何操作，非常感謝！

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1樓 2014-01-14 13:00:21

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槍下游魂

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躍龍門(mén)的魚(yú): 金幣+5, ★有幫助 2014-01-14 16:07:42

如果這個(gè)片段要參與優(yōu)化，可用opt=modredundant；
如果這個(gè)片段不參與優(yōu)化，可用opt=readfreeze；
還可以通過(guò)ONIOM分層的方式來(lái)做。
具體適用方法請(qǐng)翻閱高斯手冊(cè)

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2樓2014-01-14 13:17:35

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躍龍門(mén)的魚(yú)

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2樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2014-01-14 13:17:35
如果這個(gè)片段要參與優(yōu)化，可用opt=modredundant；
如果這個(gè)片段不參與優(yōu)化，可用opt=readfreeze；
還可以通過(guò)ONIOM分層的方式來(lái)做。
具體適用方法請(qǐng)翻閱高斯手冊(cè)

那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段

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3樓2014-01-14 13:42:10

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槍下游魂

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3樓: Originally posted by 躍龍門(mén)的魚(yú) at 2014-01-14 13:42:10
那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段...

可直接在gjf文件里面固定，GV里沒(méi)試過(guò)

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4樓2014-01-14 13:44:21

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4樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2014-01-14 13:44:21
可直接在gjf文件里面固定，GV里沒(méi)試過(guò)...

哦，那在gif文件里如何固定，是在命令那一行中嗎

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5樓2014-01-14 13:52:20

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5樓: Originally posted by 躍龍門(mén)的魚(yú) at 2014-01-14 13:52:20
哦，那在gif文件里如何固定，是在命令那一行中嗎...

分子描述之后空一行輸入，具體實(shí)現(xiàn)方法查下高斯手冊(cè)吧

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6樓2014-01-14 14:07:44

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wangsihang

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躍龍門(mén)的魚(yú): 金幣+10, ★★★很有幫助 2014-01-14 16:07:07

在高斯view的菜單欄里面專(zhuān)門(mén)有一個(gè)分層的工具，在里面可以選擇設(shè)定高層和低層，這樣低層就相當(dāng)于凍結(jié)了原子。

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7樓2014-01-14 16:05:36

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7樓: Originally posted by wangsihang at 2014-01-14 16:05:36
在高斯view的菜單欄里面專(zhuān)門(mén)有一個(gè)分層的工具，在里面可以選擇設(shè)定高層和低層，這樣低層就相當(dāng)于凍結(jié)了原子。

好的，非常感謝，我試試。

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8樓2014-01-14 16:07:26

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6樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2014-01-14 14:07:44
分子描述之后空一行輸入，具體實(shí)現(xiàn)方法查下高斯手冊(cè)吧...

好的，非常感謝

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9樓2014-01-14 16:08:00

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躍龍門(mén)的魚(yú): 金幣+5 2014-01-15 10:43:41

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3樓: Originally posted by 躍龍門(mén)的魚(yú) at 2014-01-14 13:42:10
那我如何在GASSION VIEWER中固定那些片段...

1.Edit --> redundant coordinates
2.在彈出對(duì)話框里鼠標(biāo)左鍵單擊“add”
3.用鼠標(biāo)左鍵點(diǎn)中要fix的原子（只能點(diǎn)1個(gè)）
4.在彈出對(duì)話框里選擇“cartesian coordinate”
GOTO 2.
一直到把想固定的原子選擇完畢，鼠標(biāo)左鍵單擊“OK”退出。

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10樓2014-01-15 06:54:46

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