 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1780 | 回復: 4 | |||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
29050801新蟲 (小有名氣)
|
[求助]
gaussian如何讓兩個分子逐漸靠近
|
||
|
在好多文獻了看到研究小分子和大分子的包合作用的時候有用到gaussian設置大分子在一定空間結構，小分子通過設置的坐標漸漸靠近并逐步進入大分子內。 在進入的過程中每移動一定距離都會進行分子結構的優(yōu)化和小分子的旋轉。 但是，請問如何設置小分子逐漸靠近大分子呢？ 難道是小分子和大分子之間每一個位置關系，設置一個計算輸入文件，在單獨設置小分子的旋轉二面角盡心能量優(yōu)化。如果是這樣，那么小分子的旋轉是以什么為參考標準的呢？ 如果是通過一個輸入文件設置的，請問怎么設置的呢？ 看到文獻中有提到用dummy atom設置，但是通過redundant coordinate設置dummy atom的時候，gv提示不能設置dummy atom。別的就不知道怎么弄好了。 附上想要設置的分子的幾張圖片： [ Last edited by 29050801 on 2014-1-17 at 10:07 ] |
回復此樓» 猜你喜歡
PbS量子點如何確定濃度
已經有11人回復
-
細胞培養(yǎng)，這22個細節(jié)一定要注意�。ㄒ唬�
已經有0人回復
-
物理化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經有154人回復
-
CSC訪學博后項目獲批，外方學校暫停合作該怎么辦？
已經有51人回復
-
大灣區(qū)大學劉天輝課題組招收2026級博士生（與中山大學物理學院聯(lián)合培養(yǎng)）
已經有22人回復
-
PbS量子點紫外吸收
已經有0人回復
-
比利時魯汶大學與國家留學基金委共同資助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship
已經有0人回復
-
倫敦大學學院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光譜、催化相關26年博士生
已經有11人回復
-
分子動力學模擬合作需求
已經有2人回復
-
中國科學院成都山地災害與環(huán)境研究所2026年特別研究助理（博士后）招聘啟事
已經有0人回復
» 本主題相關商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- in文件運行失�。╨ost atoms）求助��！
已經有11人回復
- gaussian可以計算多個分子的紅外光譜嗎
已經有5人回復
- 如何用gaussian軟件計算分子的振動光譜？
已經有8人回復
- 做scan時怎么保持兩個原子間鍵長不變
已經有7人回復
- 靜電勢為什么有正負值？
已經有102人回復
- 從He2等的量子化學圖形解讀范德華作用(續(xù)二)
已經有25人回復
- 從He2等的量子化學圖形解讀范德華作用(續(xù))
已經有34人回復
- 從He2等的量子化學圖形解讀范德華作用
已經有43人回復
- 怎么解釋活化能相同的兩個反應，同等條件下速率常數(shù)卻不同？
已經有11人回復
- 關于過渡態(tài)和能量優(yōu)化的問題
已經有7人回復
- Gaussianview中如何畫復雜分子
已經有5人回復
- 【求助/交流】怎么鑒別植物細胞是活著還是死了，有任何想法的都請不吝指教，謝謝
已經有13人回復
- 【求助】分子帶電荷的確定 GaussianView
已經有13人回復
- 【求助】優(yōu)化計算后偶極距選擇
已經有12人回復
29050801
新蟲 (小有名氣)
- 應助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1065.5
- 散金: 6
- 紅花: 1
- 帖子: 163
- 在線: 78.4小時
- 蟲號: 1765116
- 注冊: 2012-04-19
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物化學
送紅花一朵 
3樓2014-01-17 12:00:44
yongleli
木蟲 (正式寫手)
- 應助: 93 (初中生)
- 金幣: 3769.1
- 散金: 369
- 紅花: 24
- 帖子: 764
- 在線: 101.3小時
- 蟲號: 303595
- 注冊: 2006-12-03
- 專業(yè): 原子和分子物理
2樓2014-01-17 11:46:40
beefly
專家顧問 (職業(yè)作家)
地溝油冶煉專家
-
專家經驗: +458 - QC強帖: 12
- 應助: 88 (初中生)
- 金幣: 13002.7
- 散金: 27307
- 紅花: 300
- 帖子: 4672
- 在線: 926.9小時
- 蟲號: 408372
- 注冊: 2007-06-21
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計算化學
- 管轄: 計算模擬
4樓2014-01-17 21:10:44
29050801
新蟲 (小有名氣)
- 應助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 1065.5
- 散金: 6
- 紅花: 1
- 帖子: 163
- 在線: 78.4小時
- 蟲號: 1765116
- 注冊: 2012-04-19
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物化學
5樓2014-01-18 08:25:14
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0805 316求調劑 +3 | 大雪深藏 2026-03-18 | 3/150 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料學碩333求調劑 +3 | 北道巷 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 317求調劑 +9 | 申子申申 2026-03-19 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學085700資源與環(huán)境總分308求調劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 310求調劑 +3 | baibai1314 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 初始318分求調劑（有工作經驗） +3 | 1911236844 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 化學求調劑 +4 | 臨澤境llllll 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 295求調劑 +4 | 一志愿京區(qū)211 2026-03-18 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 294求調劑材料與化工專碩 +15 | 陌の森林 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 藥學383 求調劑 +3 | 藥學chy 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿 南京航空航天大學大學 ，080500材料科學與工程學碩 +5 | @taotao 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料與化工專碩調劑 +7 | heming3743 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 一志愿南理工085701環(huán)境302求調劑院校 +3 | 葵梓衛(wèi)隊 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研]
 320求調劑0856
+3
|
不想起名字112 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 生物學調劑招人�。�！ +3 | 山海天嵐 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考博] 26博士申請 +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 301求調劑 +4 | A_JiXing 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 有沒有道鐵/土木的想調劑南林，給自己招師弟中～ +3 | TqlXswl 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 070303 總分349求調劑 +3 | LJY9966 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 327求調劑 +6 | 拾光任染 2026-03-15 | 11/550 |
|