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moye1991新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
求助：運(yùn)行了gromacs，想查看體系的總原子數(shù)和水分子數(shù)！ 已有3人參與
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| 新手求指點(diǎn)：運(yùn)行了gromacs，想查看體系的總原子數(shù)和水分子數(shù)，要怎么做呢，求師兄師姐指點(diǎn)，感激！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
月只藍(lán): 金幣+3, 感謝指導(dǎo)！ 2014-02-19 11:05:35
moye1991: 金幣+2, ★★★很有幫助, 好的，謝謝！ 2014-02-19 11:13:01
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
月只藍(lán): 金幣+3, 感謝指導(dǎo)！ 2014-02-19 11:05:35
moye1991: 金幣+2, ★★★很有幫助, 好的，謝謝！ 2014-02-19 11:13:01
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幾個(gè)問(wèn)題，先問(wèn)問(wèn)你： 1、在你運(yùn)行g(shù)romacs之前，你是怎么建立你模擬體系的坐標(biāo)文件的(.pdb 或者.gro 文件)？ 2、gromacs手冊(cè)，有沒(méi)有先看看呢？ 3、傳說(shuō)中的 VMD 聽(tīng)說(shuō)過(guò)嗎？搜搜論壇里和VMD官網(wǎng)的資料學(xué)習(xí)一下吧，這個(gè)軟件對(duì)于MD學(xué)習(xí)非常重要。 問(wèn)題解答：總原子數(shù)在你模擬之前，肯定會(huì)知道的啊，看看你的坐標(biāo)文件，就知道了。水分子個(gè)數(shù)在你的 .top 文件里有啊。 所以，先好好看看手冊(cè)，這些問(wèn)題就不是問(wèn)題了。 |
2樓2014-02-19 10:13:45
3樓2014-02-19 21:32:53
彬哥
木蟲(chóng) (小有名氣)
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4樓2014-02-20 08:26:23
moye1991
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5樓2014-02-21 10:08:38
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