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seamas_gao1銀蟲(chóng) (小有名氣)
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求助 中國(guó)對(duì)蝦IGF-1，IGF-II 基因序列及其多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析 摘要或全文
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seamas_gao1: 金幣+50, 基金HEPI+1, ★★★★★最佳答案, 十分感謝 2014-02-22 21:55:22
seamas_gao1: 金幣+50, 基金HEPI+1, ★★★★★最佳答案, 十分感謝 2014-02-22 21:55:22
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中國(guó)對(duì)蝦IGF-Ⅰ,IGF-Ⅱ基因序列及其多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析 基本信息 批準(zhǔn)號(hào)30901101 項(xiàng)目名稱(chēng)中國(guó)對(duì)蝦IGF-Ⅰ,IGF-Ⅱ基因序列及其多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析 項(xiàng)目類(lèi)別青年科學(xué)基金項(xiàng)目 申請(qǐng)代碼C190202 項(xiàng)目負(fù)責(zé)人李朝霞 負(fù)責(zé)人職稱(chēng)副教授 依托單位青島農(nóng)業(yè)大學(xué) 研究期限2010-01-01 到 2012-12-31 資助經(jīng)費(fèi)19.0000（萬(wàn)元） 項(xiàng)目摘要 中文摘要 中國(guó)對(duì)蝦(Fenneropenaeus chinensis)是黃渤海的主要經(jīng)濟(jì)蝦類(lèi)，近些年來(lái)，由于種質(zhì)、病害和環(huán)境因素的影響，養(yǎng)殖產(chǎn)量急劇下降。培育良種已成為保障中國(guó)對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)持續(xù)發(fā)展的基礎(chǔ)，而利用分子標(biāo)記開(kāi)展重要經(jīng)濟(jì)性狀的基因定位，是分子育種的重要基礎(chǔ)。本項(xiàng)目利用同源克隆獲取對(duì)蝦IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ基因的中間片段，通過(guò)RACE技術(shù)獲得全長(zhǎng)cDNA序列，通過(guò)設(shè)計(jì)引物，克隆全長(zhǎng)DNA序列，分析IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ cDNA和DNA序列特征。選取5個(gè)不同地理群體的對(duì)蝦，測(cè)定中國(guó)對(duì)蝦體長(zhǎng)、頭胸甲長(zhǎng)、頭胸甲寬、各腹節(jié)長(zhǎng)、各腹節(jié)寬、尾節(jié)長(zhǎng)等形態(tài)指標(biāo)及體重等性狀；利用PCR-SSCP方法分析中國(guó)對(duì)蝦IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ 基因的SNP多態(tài)性，對(duì)存在基因型多態(tài)性個(gè)體進(jìn)行候選基因測(cè)序，明確SNP多態(tài)性類(lèi)型。分析多態(tài)性SNP位點(diǎn)與中國(guó)對(duì)蝦經(jīng)濟(jì)性狀之間的關(guān)聯(lián)分析，尋找與生長(zhǎng)性狀相關(guān)功能性的SNP標(biāo)記。 中文主題詞中國(guó)對(duì)蝦；FaMeT；基因克��；生長(zhǎng)性狀；關(guān)聯(lián)分析 英文摘要 英文主題詞Fenneropenaeus chinensis；FaMe；gene cloning；growth character；association analysis 結(jié)題摘要 中國(guó)對(duì)蝦(Fenneropenaeus chinensis)是黃渤海的主要經(jīng)濟(jì)蝦類(lèi)，近些年來(lái)，由于種質(zhì)、病害和環(huán)境因素的影響，養(yǎng)殖產(chǎn)量急劇下降。培育良種已成為保障中國(guó)對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)持續(xù)發(fā)展的基礎(chǔ)，而利用分子標(biāo)記開(kāi)展重要經(jīng)濟(jì)性狀的基因定位，是分子育種的重要基礎(chǔ)。甲基法尼酯（MF）在結(jié)構(gòu)上和昆蟲(chóng)的保幼激素JH-III的結(jié)構(gòu)相似，可以調(diào)節(jié)甲殼動(dòng)物生殖、卵黃發(fā)育、蛻皮、形態(tài)發(fā)生和一般蛋白質(zhì)合成等重要生物過(guò)程。甲殼動(dòng)物中，由FA轉(zhuǎn)變生成MF的限速酶為法尼酸-O-甲基轉(zhuǎn)移酶（FaMeT），鑒于其在MF形成中的重要作用，F(xiàn)aMeT被認(rèn)為在調(diào)節(jié)甲殼動(dòng)物包括生長(zhǎng)在內(nèi)的許多生理過(guò)程中起了重要作用，可作為生長(zhǎng)性狀的候選基因。首先，通過(guò)RACE的方法獲得中國(guó)對(duì)蝦PcFaMeT基因全長(zhǎng)序列，包含840bp的開(kāi)放閱讀框，可編碼280個(gè)氨基酸（GenBank Accession no：JQ315119）。氨基酸序列比對(duì)結(jié)果表明，中國(guó)對(duì)蝦與其他蝦類(lèi)的FAMeT序列同源性達(dá)81.07–96.07%。采用熒光定量PCR方法，檢測(cè)PcFaMeT基因在的時(shí)空表達(dá)特點(diǎn)，結(jié)果表明，PcFaMeT基因在各組織中廣泛分布，其中腹節(jié)肌肉中的表達(dá)量最高；整個(gè)蛻皮周期中，PcFaMeT均有表達(dá)，但隨著蛻皮周期的進(jìn)行，表達(dá)量也呈周期性變化（P＜0.05），在蛻皮間期PcFaMeT的表達(dá)量最高，表明FA轉(zhuǎn)化為MF對(duì)于觸發(fā)蛻皮過(guò)程的起始是必要的。鑒于該基因與生長(zhǎng)的關(guān)系，本試驗(yàn)進(jìn)行了SNP的檢測(cè)及生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析。研究發(fā)現(xiàn)，中國(guó)對(duì)蝦PcFaMeT基因序列中共有5個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)，其中，在163bp處發(fā)生轉(zhuǎn)換，堿基A/G，相應(yīng)氨基酸由Ile-Val；在392bp處發(fā)生顛換，堿基G/T，相應(yīng)氨基酸由Gly-Val；708bp處發(fā)生轉(zhuǎn)換，堿基A/G，編碼的氨基酸沒(méi)有發(fā)生改變；在752bp處發(fā)生轉(zhuǎn)換，堿基T/C，相應(yīng)氨基酸由Met-Thr；在818bp處發(fā)生轉(zhuǎn)換，堿基C/T，相應(yīng)氨基酸由Thr-Ile。通過(guò)等位基因特異PCR（AS-PCR）的分型方法，在中國(guó)對(duì)蝦日照群體中進(jìn)行基因型檢測(cè)，統(tǒng)計(jì)分析表明，多態(tài)性位點(diǎn)的基因型在中國(guó)對(duì)蝦日照群體中的分布符合Hardy-Weinberg平衡（P＞0.05），與經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析表明，392G/T位點(diǎn)的TT基因型與中國(guó)對(duì)蝦體重、頭胸甲寬度的相關(guān)性達(dá)到了顯著水平（P＜0.05）。 |
2樓2014-02-22 13:38:51
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