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seamas_gao1

銀蟲 (小有名氣)

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[求助] 求助中國對蝦IGF-1，IGF-II 基因序列及其多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析摘要或全文

求助摘要的編號:

30901101

項目名稱:

中國對蝦IGF-1，IGF-II 基因序列及其多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析

項目類型:

青基

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1樓 2014-02-20 09:26:36

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realyyy

禁蟲 (知名作家)

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seamas_gao1: 金幣+50, 基金HEPI+1, ★★★★★最佳答案, 十分感謝 2014-02-22 21:55:22

中國對蝦IGF-Ⅰ,IGF-Ⅱ基因序列及其多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析

基本信息
批準(zhǔn)號30901101
項目名稱中國對蝦IGF-Ⅰ,IGF-Ⅱ基因序列及其多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析
項目類別青年科學(xué)基金項目
申請代碼C190202
項目負(fù)責(zé)人李朝霞
負(fù)責(zé)人職稱副教授
依托單位青島農(nóng)業(yè)大學(xué)
研究期限2010-01-01 到 2012-12-31
資助經(jīng)費19.0000（萬元）
項目摘要
中文摘要
中國對蝦(Fenneropenaeus chinensis)是黃渤海的主要經(jīng)濟(jì)蝦類，近些年來，由于種質(zhì)、病害和環(huán)境因素的影響，養(yǎng)殖產(chǎn)量急劇下降。培育良種已成為保障中國對蝦養(yǎng)殖業(yè)持續(xù)發(fā)展的基礎(chǔ)，而利用分子標(biāo)記開展重要經(jīng)濟(jì)性狀的基因定位，是分子育種的重要基礎(chǔ)。本項目利用同源克隆獲取對蝦IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ基因的中間片段，通過RACE技術(shù)獲得全長cDNA序列，通過設(shè)計引物，克隆全長DNA序列，分析IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ cDNA和DNA序列特征。選取5個不同地理群體的對蝦，測定中國對蝦體長、頭胸甲長、頭胸甲寬、各腹節(jié)長、各腹節(jié)寬、尾節(jié)長等形態(tài)指標(biāo)及體重等性狀；利用PCR-SSCP方法分析中國對蝦IGF-Ⅰ、IGF-Ⅱ 基因的SNP多態(tài)性，對存在基因型多態(tài)性個體進(jìn)行候選基因測序，明確SNP多態(tài)性類型。分析多態(tài)性SNP位點與中國對蝦經(jīng)濟(jì)性狀之間的關(guān)聯(lián)分析，尋找與生長性狀相關(guān)功能性的SNP標(biāo)記。
中文主題詞中國對蝦；FaMeT；基因克隆；生長性狀；關(guān)聯(lián)分析
英文摘要
英文主題詞Fenneropenaeus chinensis；FaMe；gene cloning；growth character；association analysis
結(jié)題摘要
中國對蝦(Fenneropenaeus chinensis)是黃渤海的主要經(jīng)濟(jì)蝦類，近些年來，由于種質(zhì)、病害和環(huán)境因素的影響，養(yǎng)殖產(chǎn)量急劇下降。培育良種已成為保障中國對蝦養(yǎng)殖業(yè)持續(xù)發(fā)展的基礎(chǔ)，而利用分子標(biāo)記開展重要經(jīng)濟(jì)性狀的基因定位，是分子育種的重要基礎(chǔ)。甲基法尼酯（MF）在結(jié)構(gòu)上和昆蟲的保幼激素JH-III的結(jié)構(gòu)相似，可以調(diào)節(jié)甲殼動物生殖、卵黃發(fā)育、蛻皮、形態(tài)發(fā)生和一般蛋白質(zhì)合成等重要生物過程。甲殼動物中，由FA轉(zhuǎn)變生成MF的限速酶為法尼酸-O-甲基轉(zhuǎn)移酶（FaMeT），鑒于其在MF形成中的重要作用，F(xiàn)aMeT被認(rèn)為在調(diào)節(jié)甲殼動物包括生長在內(nèi)的許多生理過程中起了重要作用，可作為生長性狀的候選基因。首先，通過RACE的方法獲得中國對蝦PcFaMeT基因全長序列，包含840bp的開放閱讀框，可編碼280個氨基酸（GenBank Accession no：JQ315119）。氨基酸序列比對結(jié)果表明，中國對蝦與其他蝦類的FAMeT序列同源性達(dá)81.07–96.07%。采用熒光定量PCR方法，檢測PcFaMeT基因在的時空表達(dá)特點，結(jié)果表明，PcFaMeT基因在各組織中廣泛分布，其中腹節(jié)肌肉中的表達(dá)量最高；整個蛻皮周期中，PcFaMeT均有表達(dá)，但隨著蛻皮周期的進(jìn)行，表達(dá)量也呈周期性變化（P＜0.05），在蛻皮間期PcFaMeT的表達(dá)量最高，表明FA轉(zhuǎn)化為MF對于觸發(fā)蛻皮過程的起始是必要的。鑒于該基因與生長的關(guān)系，本試驗進(jìn)行了SNP的檢測及生長性狀的關(guān)聯(lián)分析。研究發(fā)現(xiàn)，中國對蝦PcFaMeT基因序列中共有5個單核苷酸多態(tài)性位點，其中，在163bp處發(fā)生轉(zhuǎn)換，堿基A/G，相應(yīng)氨基酸由Ile-Val；在392bp處發(fā)生顛換，堿基G/T，相應(yīng)氨基酸由Gly-Val；708bp處發(fā)生轉(zhuǎn)換，堿基A/G，編碼的氨基酸沒有發(fā)生改變；在752bp處發(fā)生轉(zhuǎn)換，堿基T/C，相應(yīng)氨基酸由Met-Thr；在818bp處發(fā)生轉(zhuǎn)換，堿基C/T，相應(yīng)氨基酸由Thr-Ile。通過等位基因特異PCR（AS-PCR）的分型方法，在中國對蝦日照群體中進(jìn)行基因型檢測，統(tǒng)計分析表明，多態(tài)性位點的基因型在中國對蝦日照群體中的分布符合Hardy-Weinberg平衡（P＞0.05），與經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析表明，392G/T位點的TT基因型與中國對蝦體重、頭胸甲寬度的相關(guān)性達(dá)到了顯著水平（P＜0.05）。

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2樓2014-02-22 13:38:51

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