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whqllj金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
用sybyl做docking后，得到的分子沒(méi)有電荷
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我用sybyl 做完docking 得到的分子構(gòu)象 看了一下電荷 都是零 為什么呀？ 是我哪里操作錯(cuò)了嗎？ 請(qǐng)高手解答下 |
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whqllj(月只藍(lán)代發(fā)): 金幣+3, 感謝指導(dǎo)！ 2014-04-21 21:40:39
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可能是因?yàn)閷?duì)接前的小分子沒(méi)有compute charge,導(dǎo)致ligand小分子各原子電荷都為零�？梢試L試：在對(duì)接前對(duì)小分子計(jì)算電荷，指令為compute/charge/G_M [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
2樓2014-02-23 23:50:41
whqllj
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3樓2014-02-24 11:42:52
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4樓2014-02-24 17:32:35
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月只藍(lán): 金幣+5, 感謝分享問(wèn)題的解決辦法！ 2014-02-24 20:22:06
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跟公司的技術(shù)支持溝通了下，原來(lái)是docking的時(shí)候蛋白和小分子是連個(gè)力場(chǎng)，所以docking完系統(tǒng)不知道用哪個(gè)力場(chǎng)計(jì)算，所以像二樓說(shuō)的 通過(guò)computer-charge-G-H就可以得到電荷分布了。 |
5樓2014-02-24 20:01:31
齊春艷
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6樓2015-10-12 15:31:01
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