ranger2911

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[交流] 利用VASP進(jìn)行收斂性測試，循環(huán)計(jì)算中途停止問題

本人剛剛開始接觸VASP，想測試FCC Ni的截?cái)嗄�，但是提交任�?wù)后程序總是中途停止，想請(qǐng)各位大俠幫忙看看問題出在哪里。下面是相關(guān)的輸入文件：
1、POSCAR
FCC Ni
1.0
3.5299999714       0.0000000000       0.0000000000
0.0000000000       3.5299999714       0.0000000000
0.0000000000       0.0000000000       3.5299999714
4
Direct
0.000000000       0.000000000       0.000000000
0.000000000       0.500000000       0.500000000
0.500000000       0.000000000       0.500000000
0.500000000       0.500000000       0.000000000

2、KPOINTS （由于是先測試ENCUT，所以KPOINTS設(shè)定了一個(gè)相對(duì)較大的值）
Automatic
0
Monkhorst-Pack
25 25 25
0 0 0

3、POTCAR
POTCAR是根據(jù)User's Guide第10章中給出的推薦值

4、INCAR
這里的INCAR文件使用PBS腳本文件代替
#PBS -l nodes=2:ppn=8

NPROC=`wc -l $PBS_NODEFILE|cut -f1 -d" "`

cd $PBS_O_WORKDIR
for a in 250 300 350 400 450 500 550 600 650 700 750 800
do
rm -f WAVECAR
cat >INCAR<<!
SYSTEM = FCC Ni
ISTART = 0; ICHARG = 2
ENCUT = $a
PREC = Accurate
ISMEAR = -5
NSW = 0; IBRION = -1
ISPIN = 2
!
echo a=$a
/public/software/mpi/openmpi1.3.4-intel/bin/mpirun -mca btl openib,self -np $NPROC /public/software/vasp/vasp-openmpi-ifort
E=`tail -1 OSZICAR`
echo $a $E>>result
done

現(xiàn)在的問題是提交任務(wù)之后程序會(huì)運(yùn)行一段時(shí)間，但是過一會(huì)就停止了，并沒有跑完所有設(shè)定的循環(huán)值，WAVECAR為0K，并給出下面的提示：
a=300
running on 16 nodes
distr:  one band on 1 nodes, 16 groups
vasp.4.6.28 25Jul05 complex
POSCAR found :  1 types and 4 ions
LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...          1
reading WAVECAR
entering main loop
   N    E                   dE          d eps    ncg    rms       rms(c)
16 total processes killed (some possibly by mpirun during cleanup)

另一個(gè)輸出文件給出這樣的信息
=>> PBS: job killed: walltime 3641 exceeded limit 3600
mpirun: killing job...

--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 0 with PID 20528 on node node13 exited on signal 0 (Unknown signal 0).
--------------------------------------------------------------------------
mpirun: clean termination accomplished

我在這里糾結(jié)一天多了，連個(gè)截?cái)嗄芏紱]算出來，還請(qǐng)各位大俠幫忙找找問題啊~

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1樓 2014-03-02 19:59:24

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emilyoyang

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ranger2911: 金幣+5, 多謝你的回答，確實(shí)是這么回事啊~ 2014-03-03 18:00:43

在PBS作業(yè)提交腳本里面的#PBS -l nodes=2:ppn=8 下面添加下面一行試試
#PBS -l walltime=240:00:00

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2樓2014-03-02 23:45:32

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2樓: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-02 23:45:32
在PBS作業(yè)提交腳本里面的#PBS -l nodes=2:ppn=8 下面添加下面一行試試
#PBS -l walltime=240:00:00

請(qǐng)問為什么要加這行，能解釋下嗎

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3樓2016-05-10 13:50:15

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引用回帖:

3樓: Originally posted by yuenanshuyao at 2016-05-10 13:50:15
請(qǐng)問為什么要加這行，能解釋下嗎

...

the default setting of walltime is too short for your testing.
This line says you set the walltime 240hrs.(10days, may be somewhat longer, but it does work)

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4樓2016-05-11 06:46:08

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