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123456qi木蟲 (職業(yè)作家)
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[求助]
什么情況，未進(jìn)入結(jié)合腔？怎么辦？ 已有2人參與
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| 做了個新分子，與先導(dǎo)相比，新分子未完全進(jìn)入原有的結(jié)合腔，但還是和幾個蛋白形成了氫鍵！文章里要用可以嗎？怎么說？ |
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123456qi
木蟲 (職業(yè)作家)
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4樓2014-03-10 17:30:12
3樓2014-03-10 16:32:12
monsoncupid
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【答案】應(yīng)助回帖
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123456qi: 金幣+10, ★★★很有幫助 2014-03-10 21:45:24
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123456qi: 金幣+10, ★★★很有幫助 2014-03-10 21:45:24
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你說的意思是配體沒進(jìn)蛋白的原有活性位點(diǎn)，然后和蛋白上的幾個氨基酸殘基有氫鍵，結(jié)合能也不錯，問這種結(jié)果能用不能用是么？ 應(yīng)該是可以用的，如果想進(jìn)一步調(diào)整參數(shù)讓他完全進(jìn)入的話，你可以調(diào)整一下binding site 的一些參數(shù)比如半徑和坐標(biāo)，但實際上不用完全進(jìn)入，配體有差異不一定完全進(jìn)入，如果還是不放心跑個動力學(xué)驗證一下 |
5樓2014-03-10 21:25:42
123456qi
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6樓2014-03-10 21:45:19
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