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[求助]
求助，16S rDNA測定了i兩株菌的序列，大神們可以幫我分析下么？謝謝~！ 已有5人參與
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用到論文里，就是想交代清楚篩選出的到底是什么菌，生理生化沒做，ＡＰＩ太貴，老板不管買。。。實(shí)驗(yàn)室也沒有條件做。 光靠序列能鑒別到什么程度呢？能不能構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹啊。。 第一個(gè) CAACATTTTCCCCCCCCCTTTCCCGTAGCGTTGCTGCGCCACCGGACAGTATACTGCCCGACGGCTAACATTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCACCTCAGCGTCAGTAATGGACCAGTAAGCCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCGAATATCTACGAATTTCACCTCTACACTCGGAATTCCACTTACCTCTTCCATACTCAAGATACCCAGTATCAAAGGCAGTTCCGCAGTTGAGCTGCGGGATTTCACCCCTGACTTAAATATCCGCCTACGTGCGCTTTACGCCCAGTAATTCCGAACAACGCTAGCCCCCTTCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGAAGTTAGCCGGGGCTTCTTCTCCGACTACCGTCATTATCTTCATCGGTGAAAGAGCTTTACAACCCTAAGGCCTTCATCACTCACGCGGCATGGCTGGATCAGGCTTGCGCCCATTGTCCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTTTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAATGTGGCTGATCATCCTCTCAGACCAGCTATGGATCGTCGCCTTGGTAGGCCTTTACCCCACCAACTAGCTATTCCAACGCGGGCCAATCCTTCCCCGATAAAATCTTTCCCCCGTAGGGCGTATGCGGTATTAATTCCAGTTTCCCGGAGCTATTCCGCAGGAAAAGGGTATGTTCCCACGCGTTACTCAACCCGTTCTGCCACTCCCCTTTGCGGGGCGTTCTGACTTGCATGTGTTAAAGCCTGGCCGCT 第二個(gè) GCGCATTGCGCTGCTTCGATACTGCGTGCCAATTGCACCCAACATCCAGTTCGCATCGTTTAGGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGTGCCTCAGTGTCAGTGTTGGTCCAGGTAGCTGCCTTCGCCATGGATGTTCCTCCTGATCTCTACGCATTTCACTGCTACACCAGGAATTCCGCTACCCTCTACCACACTCTAGTCGCCCAGTATCCACTGCAGTTCCCAGGTTGAGCCCAGGGCTTTCACAACGGACTTAAACGACCACCTACGCACGCTTTACGCCCAGTAATTCCGAGTAACGCTTGCACCCTTCGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGAAGTTAGCCGGTGCTTATTCTTTGGGTACCGTCATCCCAACCGGGTATTAGCCAGCTGGATTTCTTTCCCAACAAAAGGGCTTTACAACCCGAAGGCCTTCTTCACCCACGCGGTATGGCTGGATCAGGCTTGCGCCCATTGTCCAATATTCCCCACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGACCGTGTCTCAGTTCCAGTGTGGCTGATCATCCTCTCAGACCAGCTACGGATCGTCGCCTTGGTGGGCCTTTACCCCGCCAACTAGCTAATCCGACATCGGCTCATTCAATCGCGCAAGGTCCGAAGATCCCCTGCTTTCACCCGTAGGTCGTATGCGGTATTAGCGTAAGTTTCCCTACGTTATCCCCCACGACAGAGTAGATTCCGATGTATTCCTCACCCGTCCGCCACTCGCCACCCAGGGAGCAAGCTCCTCTGTGCTGCCGTTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTACCGCCAGCGTTTCACTCTGAGCCAGGATTCAAAACTTCTGACG |
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ctt1984
木蟲 (正式寫手)
初學(xué)者
- 應(yīng)助: 16 (小學(xué)生)
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- 專業(yè): 食品加工技術(shù)
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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第一個(gè)： Agrobacterium tumefaciens strain http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#alnHdr_161172602 第二個(gè)：Stenotrophomonas maltophilia http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi#alnHdr_253994666 至于進(jìn)化樹，可以做的。但是需要你根據(jù)測序結(jié)果，篩選一些你感興趣的微生物序列一起去做 |
7樓2014-03-13 15:30:07
3樓2014-03-13 08:57:36
dllchina
木蟲 (著名寫手)
有機(jī)的微生物大神
- MicEPI: 8
- 應(yīng)助: 350 (大學(xué)生)
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- 注冊: 2010-02-08
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物物理、生物化學(xué)與分子
4樓2014-03-13 10:41:39
5樓2014-03-13 13:05:53
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