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mailchensu鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
尋求把細(xì)菌的16s rDNA序列提交到Genbank,申請(qǐng)accession number 的專家-謝謝!
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| 尋求可以幫我把測(cè)到的2株細(xì)菌的16s rDNA序列提交到Genbank 的專家。篩選到了2株細(xì)菌,想申請(qǐng)accession number,群里面的相關(guān)介紹也看了一下,提交過程很復(fù)雜,對(duì)微生物及分子生物學(xué)這方面我又很不了解,期待可以找到一位這方面的專家?guī)椭乙幌隆7浅8兄x! |
金蟲 (小有名氣)
木蟲 (正式寫手)
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提交序列一般有兩種方法,一種是在線提交Bankit,另外一種是用軟件提交Sequin。 http://liucheng.name/466/ 這里介紹的是bankit舊版的操作過程,現(xiàn)在改為新版,內(nèi)容大同小異,就是提前注冊(cè)一個(gè)賬號(hào),然后按照頁面提示,把你的菌株的基本信息填寫進(jìn)去,如果過程中出錯(cuò)會(huì)有提示,提交后genebank也會(huì)有郵件通知你的提交情況。 |

木蟲 (小有名氣)
| 16s rDNA序列提交到Genbank,需要以下步驟:1)先在BLAST上比對(duì)確定你的細(xì)菌分類地位 2)然后建立一個(gè)TXT文檔,里面按照以下格式:>此處填寫你的菌株編號(hào)[organism=此處填寫你的菌株的種屬] [strain=此處是你的菌株編號(hào)] 后面緊跟上是你的序列 3)然后將這個(gè)文檔導(dǎo)入到sequin軟件中進(jìn)行編輯所生成的文件保存4)最后將該文件通過郵件形式發(fā)送到NCBI中(郵件地址在你使用sequin軟件編輯時(shí)系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)告訴你)。祝你提交成功! |

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