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mailchensu鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
尋求把細(xì)菌的16s rDNA序列提交到Genbank，申請accession number 的專家-謝謝！
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| 尋求可以幫我把測到的2株細(xì)菌的16s rDNA序列提交到Genbank 的專家。篩選到了2株細(xì)菌，想申請accession number，群里面的相關(guān)介紹也看了一下，提交過程很復(fù)雜，對微生物及分子生物學(xué)這方面我又很不了解，期待可以找到一位這方面的專家?guī)椭乙幌�。非常感謝！ |
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zhaoyu2881
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
mailchensu(金幣+10): 謝謝！ 2011-09-05 14:13:16
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提交序列一般有兩種方法，一種是在線提交Bankit，另外一種是用軟件提交Sequin。 http://liucheng.name/466/ 這里介紹的是bankit舊版的操作過程，現(xiàn)在改為新版，內(nèi)容大同小異，就是提前注冊一個賬號，然后按照頁面提示，把你的菌株的基本信息填寫進去，如果過程中出錯會有提示，提交后genebank也會有郵件通知你的提交情況。  |
3樓2011-09-03 16:26:20
2樓2011-09-02 15:16:21
kingleo99
木蟲 (小有名氣)
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【答案】應(yīng)助回帖
mailchensu(金幣+10): 非常感謝！ 2011-09-08 20:00:40
| 16s rDNA序列提交到Genbank，需要以下步驟：1）先在BLAST上比對確定你的細(xì)菌分類地位 2）然后建立一個TXT文檔，里面按照以下格式：>此處填寫你的菌株編號[organism=此處填寫你的菌株的種屬] [strain=此處是你的菌株編號] 后面緊跟上是你的序列 3）然后將這個文檔導(dǎo)入到sequin軟件中進行編輯所生成的文件保存4）最后將該文件通過郵件形式發(fā)送到NCBI中（郵件地址在你使用sequin軟件編輯時系統(tǒng)會自動告訴你）。祝你提交成功！ |
4樓2011-09-08 17:30:35
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