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1164028932金蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何讓計算離子從晶體內(nèi)部擴散到表面的能量?
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鋇長石晶體在硫酸鹽環(huán)境中,內(nèi)部的的鋇離子會擴散出去和硫酸根生成硫酸鋇,圖中的綠顏色的離子是鋇離子,怎么樣計算鋇離子擴散出去的能量呢? 鋇長石晶體結(jié)構(gòu).png [ Last edited by 1164028932 on 2014-3-16 at 19:35 ] |
第一性原理 |
木蟲 (知名作家)
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1.仔細(xì)研究一下晶體結(jié)構(gòu),看看有哪些可能的擴散通道; 2.確定晶體可能的暴露面; 3.將上述兩點結(jié)合起來,確定離子擴散方式,然后象處理化學(xué)反應(yīng)那樣,算擴散能壘 4.如果無法確定擴散通道,那就把可能情況都做一下,比較討論 僅供參考 |
木蟲 (知名作家)
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我用vasp. 你用ms嗎?這個我不熟悉,發(fā)一個ppt給你,里面有很大篇幅討論過渡態(tài)搜索問題以及參數(shù)設(shè)置方法,你參考一下。主要用dmol3模塊 |
專家顧問 (著名寫手)
Ab Initio Amateur
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肯定要構(gòu)造一個表面,這個表面就是3L前輩說的暴露面,如果實驗?zāi)軌虼_定是最好的,如果單單從First Principle的話,至少幾個基本面都要看看。然后構(gòu)造表面,這個從體結(jié)構(gòu)cleave就行了(注意層數(shù)要足夠高,晶面要足夠大)。優(yōu)化離子未脫出(嵌入)的模型,另外建立一個離子脫出(也許)呈吸附狀態(tài)的模型,也優(yōu)化一下,一般從表面的格子擴散到表面應(yīng)該不會出現(xiàn)別的中間體,所以在這兩個狀態(tài)之間的應(yīng)該就是過渡態(tài)。然后使用Tools-reaction preview,脫出前的(優(yōu)化好的)xsd文件作為reactant,脫出后的(優(yōu)化好的)作為product,把遷移過程中對應(yīng)的atom一個個match一下,全部match后就可以preview。此時就構(gòu)造出的xtd就是path的軌跡。在xtd上做TS search即可。不過TS confirm用的NEB的方法,相當(dāng)費時間。 |

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金蟲 (初入文壇)
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