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求助宏基因組高通量測(cè)序微生態(tài)研究 已有4人參與
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| 最近要做泡菜的微生態(tài)研究,就是想用宏基因組高通量測(cè)序代替pcr-dgge,但是對(duì)那一塊我查文獻(xiàn)都不知道從哪里下手,請(qǐng)問(wèn)大蝦們有誰(shuí)做過(guò)這方面的啊。我主要做的是檢測(cè)泡菜每個(gè)發(fā)酵階段中微生物的主要種類(lèi),怎么提取總DNA啊,然后怎么做才可以拿出去測(cè)序呢 |
銅蟲(chóng) (職業(yè)作家)
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所謂宏基因組學(xué) (或元基因組學(xué), metagenomics) 就是一種以環(huán)境樣品中的微生物群體基因組為研究對(duì)象, 以功能基因篩選和/或測(cè)序分析為研究手段, 以微生物多樣性、 種群結(jié)構(gòu)、 進(jìn)化關(guān)系、 功能活性、 相互協(xié)作關(guān)系及與環(huán)境之間的關(guān)系為研究目的的新的微生物研究方法。一般包括從環(huán)境樣品中提取基因組 DNA, 進(jìn)行高通量測(cè)序分析,或克隆DNA到合適的載體,導(dǎo)入宿主菌體,篩選目的轉(zhuǎn)化子等工作。 可以選擇核酸總提取試劑盒,具體可以參照不同公司產(chǎn)品的說(shuō)明書(shū)。 |
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