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zyl623008624金蟲 (正式寫手)
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[求助]
基質(zhì)金屬蛋白酶MMP-2的酶切位點(diǎn)或序列 已有2人參與
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| 如題：哪位大神能查到基質(zhì)金屬蛋白酶MMP-2的酶切位點(diǎn)或序列，不是那種短肽的 |
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youlinglyw
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zyl623008624: 金幣+5, ★有幫助 2014-03-31 10:48:48
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zyl623008624: 金幣+5, ★有幫助 2014-03-31 10:48:48
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我把該基因序列和酶切位點(diǎn)上傳到了網(wǎng)盤，你下載下來看一下（頁數(shù)很多，因?yàn)樵摶蛴?5k左右，很大） http://pan.baidu.com/s/1kTK9ZyZ 授之以魚不如授之以漁，下面是具體方法，希望對你有幫助 你在ncbi上搜索MMP-2 然后找到序列 把序列輸入到bioedit上，直接就生成了所有酶切位點(diǎn)。 |
2樓2014-03-26 16:50:31
youlinglyw
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【答案】應(yīng)助回帖
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zyl623008624: 金幣+5, ★有幫助 2014-03-31 10:48:59
zyl623008624: 金幣+5, ★有幫助 2014-03-31 10:48:59
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簡單的列一下如下，包括，限制酶切圖，酶切頻率 Restriction Enzyme Map: 1 ACATCTGGCGGCTGCCCTCCCTTGTTTCCGCTGCATCCAGACTTCCTCAGGCGGTGGCTGGAGGCTGCGCATCTGGGGCT 80 1 TGTAGACCGCCGACGGGAGGGAACAAAGGCGACGTAGGTCTGAAGGAGTCCGCCACCGACCTCCGACGCGTAGACCCCGA 80 BbvI MnlI BstF5I SfaNI BbvI BspCNI FspI MwoI FokI MspA1I Bsu36I MnlI BseMII HpyF10VI Hpy188III MnlI SfaNI BpmI Eco57MI Enzyme Recognition frequency Positions __________________________________________________________________________ AarI CACCTGCnnnn'nnnn_ 5 9289, 9596, 17883, 20267, 22078 AccI GT'mk_AC 14 2006, 3161, 5246, 5457, 5512 5658, 5878, 5937, 7637, 10893 14335, 14637, 17214, 17854 Enzymes that cut five or fewer times Enzyme Recognition frequency Positions __________________________________________________________________________ AarI CACCTGCnnnn'nnnn_ 5 9289, 9596, 17883, 20267, 22078 Acc65I G'GTAC_C 1 19164 AfeI AGC'GCT 3 306, 2169, 13024 AflII C'TTAA_G 4 2532, 13250, 23176, 25881 AgeI A'CCGG_T 2 9546, 14123 AhdI GACnn_n'nnGTC 4 2245, 3496, 16624, 17131 Enzymes that do not cut: _________________________________________________________ AatII, AclI, AscI, AsiSI, BcgI, BcgI, BsiWI, ClaI, FseI, NotI, PmeI, PvuI, RsrII SalI, SfiI, SgrAI, SnaBI, SrfI, ZraI |
3樓2014-03-27 10:04:53
zyl623008624
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