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小小鑫000

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[求助] 用vasp優(yōu)化Ni2團(tuán)簇出現(xiàn)的問題！已有1人參與

各位前輩，大家好：
最近用vasp優(yōu)化Ni2團(tuán)簇，將Ni2放到邊長為13的立方體盒子中，Ni，Ni 鍵長為2.42，KPOINTS，gamma下的kmesh不知道取多少，
Automatic generation
Gamma
-    - -
0.0 0.0 0.0
于是就分別取2到13進(jìn)行KPOINTS的收斂性測試，取到9還正常，但沒有收斂，但從10開始，機(jī)器計算出現(xiàn)異常，如下：--------------------------------------------------------
  JOBID: 46876.cn061
  The job was started at Thu Mar 27 11:48:27 CST 2014
  The job was running at cn012.
k mesh = 10 x 10 x 10
running on 4 nodes
distr:  one band on 1 nodes, 4 groups
vasp.5.2.12 26May11 complex
POSCAR found type information on POSCAR  Ni
POSCAR found :  1 types and    2 ions
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(          1 )
WAVECAR not read
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 0 with PID 16304 on node cn012 exited on signal 9 (Killed).
--------------------------------------------------------------------------

real 1m4.034s
user 0m14.805s
sys 0m11.433s
k mesh = 11 x 11 x 11
running on 4 nodes
distr:  one band on 1 nodes, 4 groups
vasp.5.2.12 26May11 complex
POSCAR found type information on POSCAR  Ni
POSCAR found :  1 types and    2 ions
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
FFT: planning ...(          1 )
WAVECAR not read
--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that process rank 0 with PID 16324 on node cn012 exited on signal 9 (Killed).
。。。
這是怎么回事？望高手指導(dǎo)，感激不盡！

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【求助完結(jié)】vasp優(yōu)化結(jié)構(gòu)運行一段時間后沒有出現(xiàn)錯誤，但是停止了！已經(jīng)有20人回復(fù)

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1樓 2014-03-28 18:28:27

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
小小鑫000: 金幣+5 2014-03-28 20:15:53

你的錯誤原因是內(nèi)存不足
KPOINTS應(yīng)該為
Automatic generation
Gamma
1 1 1
0.0 0.0 0.0

你取的K點密度太高了！

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2樓2014-03-28 19:56:19

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前輩，那意思就是說所有大小團(tuán)簇優(yōu)化，都是kpoint下的gamma都取111.不需要進(jìn)行收斂性測試？

[ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ]

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3樓2014-03-28 20:18:38

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引用回帖:

2樓: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-28 19:56:19
你的錯誤原因是內(nèi)存不足
KPOINTS應(yīng)該為
Automatic generation
Gamma
1 1 1
0.0 0.0 0.0

你取的K點密度太高了！

前輩，那意思就是說所有大小團(tuán)簇優(yōu)化，都是kpoint下的gamma都取111.不需要進(jìn)行收斂性測試？

[ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ]

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4樓2014-03-28 20:19:09

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emilyoyang

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小小鑫000: 金幣+5 2014-03-29 10:25:48

引用回帖:

4樓: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-03-28 20:19:09
前輩，那意思就是說所有大小團(tuán)簇優(yōu)化，都是kpoint下的gamma都取111.不需要進(jìn)行收斂性測試？
...

是的因為你的box邊長取的很大僅需gamma點即可

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5樓2014-03-28 21:18:37

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5樓: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-28 21:18:37
是的因為你的box邊長取的很大僅需gamma點即可...

謝謝前輩，我gamma下取111，進(jìn)行encut的收斂性測試，結(jié)果機(jī)器運算出現(xiàn)異常，如下:
JOBID: 47025.cn061
  The job was started at Fri Mar 28 22:36:03 CST 2014
  The job was running at cn012.
ENCUT = 350 eV
running on 4 nodes
distr:  one band on 1 nodes, 4 groups
vasp.5.2.12 26May11 complex
POSCAR found type information on POSCAR  Ni
POSCAR found :  1 types and    2 ions
LDA part: xc-table for Ceperly-Alder, standard interpolation

VERY BAD NEWS! internal error in subroutine IBZKPT:
Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =    1

VERY BAD NEWS! internal error in subroutine IBZKPT:
Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =    1

VERY BAD NEWS! internal error in subroutine IBZKPT:

VERY BAD NEWS! internal error in subroutine IBZKPT:
Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =    1
Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT =    1

real 0m1.609s
user 0m0.544s
sys 0m0.216s
這是怎么回事，但我取222，就能正常運算，但encut取從350取到500也沒收斂，是怎么回事?

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6樓2014-03-29 10:43:42

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引用回帖:

6樓: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-03-29 10:43:42
謝謝前輩，我gamma下取111，進(jìn)行encut的收斂性測試，結(jié)果機(jī)器運算出現(xiàn)異常，如下:
JOBID: 47025.cn061
  The job was started at Fri Mar 28 22:36:03 CST 2014
  The job was running at cn012.
ENCUT = 350  ...

ISMEAR取0 不要用-5

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7樓2014-03-29 16:22:49

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7樓: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-29 16:22:49
ISMEAR取0 不要用-5...

那前輩，為什么不能取-5.靜態(tài)計算不是都取-5嗎？取0的話，sigmar取多少呀？謝謝前輩了！

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8樓2014-03-29 22:06:53

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★ ★ ★
小小鑫000: 金幣+3 2014-03-30 16:56:28

引用回帖:

8樓: Originally posted by 小小鑫000 at 2014-03-29 22:06:53
那前輩，為什么不能取-5.靜態(tài)計算不是都取-5嗎？取0的話，sigmar取多少呀？謝謝前輩了！
...

你的錯誤不是提示說 Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT = 1
1個k點不能用Tetrahedron method
你應(yīng)該仔細(xì)看看manual ismear那一項的介紹上面寫的很清楚

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9樓2014-03-30 12:52:56

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9樓: Originally posted by emilyoyang at 2014-03-30 12:52:56
你的錯誤不是提示說 Tetrahedron method fails for NKPT<4. NKPT = 1
1個k點不能用Tetrahedron method
你應(yīng)該仔細(xì)看看manual ismear那一項的介紹上面寫的很清楚...

前輩，盒子只能取成立方體的嗎，取成長方體的行不行？

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10樓2014-04-01 11:44:36

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