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飄落的丘陵金蟲 (正式寫手)
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[求助]
求大神幫忙~用sybyl做COMFA時q2值太小，有時還是負的，怎么提高q2？ 已有3人參與
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用sybyl做COMFA時q2值太小，有時還是負的，SEE的值大，r2值小，怎么提高q2？ 用對接的方式做的疊q2為0.013，而用骨架疊合時q2為負值，求大神幫忙，這怎么提高q2啊？ |
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YILUK
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3樓2014-04-06 11:23:51
2樓2014-04-03 08:36:54
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金蟲 (正式寫手)
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4樓2014-04-06 15:52:29
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【答案】應(yīng)助回帖
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飄落的丘陵: 金幣+10, ★★★很有幫助 2014-04-12 11:04:42
月只藍: 金幣+3, 感謝指導(dǎo) 2014-04-13 09:20:43
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月只藍: 金幣+3, 感謝指導(dǎo) 2014-04-13 09:20:43
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能量優(yōu)化也有不同方法，例如sybyl自己的minimize跟Gauss的優(yōu)化結(jié)果就不同，后者結(jié)果更好，計算時間長很多。能量優(yōu)化畢竟是在初始構(gòu)象開始，所以你的初始構(gòu)象會影響你能量優(yōu)化的結(jié)果，有些時候會試用晶體構(gòu)象或者對接構(gòu)象做初始點。 |
5樓2014-04-12 01:07:20
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