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[求助]
mdp文件中“Output control”的參數(shù)設(shè)置？ 已有3人參與
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| 之前在運(yùn)算完nvt和npt之后，生成的.trr文件都是30多G，怎么這么大呀，請教各位大神，是不是需要調(diào)節(jié)mdp參數(shù)里的“Output control”部分，讓輸出的文件變小一點(diǎn)？這個調(diào)整有什么規(guī)律嗎？能根據(jù)步長的改變在之前的模板上相應(yīng)倍數(shù)調(diào)整輸出頻率嗎？謝謝！！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
月只藍(lán): 金幣+3, 感謝指導(dǎo)！ 2014-04-08 19:03:52
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月只藍(lán): 金幣+3, 感謝指導(dǎo)！ 2014-04-08 19:03:52
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1、RTFM 2、直接關(guān)掉.trr格式的文件輸出，輸出xtc文件就行了。 3、例如我的輸出控制部分： ; OUTPUT CONTROL OPTIONS = ; Output frequency for coords (x), velocities (v) and forces (f) = nstxout = 0 nstvout = 0 nstfout = 0 ; Output frequency for energies to log file and energy file = nstlog = 1000 nstenergy = 1000 ; Output frequency and precision for xtc file = nstxtcout = 25000 xtc_precision = 100 看明白這幾個參數(shù)的意義，根據(jù)自己的需求去調(diào)節(jié) |
3樓2014-04-08 13:51:18
fangsteel
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10樓2014-04-08 14:38:52
lisuperyao
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2樓2014-04-08 13:05:02
fangsteel
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9樓2014-04-08 14:32:53
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