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[求助]
mdp文件中“Output control”的參數(shù)設(shè)置? 已有3人參與
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| 之前在運算完nvt和npt之后,生成的.trr文件都是30多G,怎么這么大呀,請教各位大神,是不是需要調(diào)節(jié)mdp參數(shù)里的“Output control”部分,讓輸出的文件變小一點?這個調(diào)整有什么規(guī)律嗎?能根據(jù)步長的改變在之前的模板上相應(yīng)倍數(shù)調(diào)整輸出頻率嗎?謝謝! |
木蟲 (正式寫手)

鐵桿木蟲 (職業(yè)作家)
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1、RTFM 2、直接關(guān)掉.trr格式的文件輸出,輸出xtc文件就行了。 3、例如我的輸出控制部分: ; OUTPUT CONTROL OPTIONS = ; Output frequency for coords (x), velocities (v) and forces (f) = nstxout = 0 nstvout = 0 nstfout = 0 ; Output frequency for energies to log file and energy file = nstlog = 1000 nstenergy = 1000 ; Output frequency and precision for xtc file = nstxtcout = 25000 xtc_precision = 100 看明白這幾個參數(shù)的意義,根據(jù)自己的需求去調(diào)節(jié) |
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