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[求助] 無(wú)序體系的建模問(wèn)題已有3人參與

模擬無(wú)序體系，其中有Li1.4RuO3,有四個(gè)鋰的位置，各占0.7。不知道該怎么建立模型,想用castep算一下能帶和態(tài)密度,甚是頭大。懇請(qǐng)各位大神指點(diǎn)一二。
data for ICSD #78722
Coll Code 78722
Rec  Date 1997/05/13
Chem Name Lithium Ruthenium Oxide (1.4/1/3)
Structured  Li1.4 Ru O3
Sum       Li1.4 O3 Ru1
ANX       A8B11X24
D(calc)    5.05
Title    Structure and lithium deintercalation of Li2-x Ru O3
Author(s) Kobayashi, H.;Kanno, R.;Kawamoto, Y.;Tabuchi, M.;Nakamura, O.;Tanako,
         M.
Reference Solid State Ionics
         (1995), 82, 25-31
Unit Cell 4.9398(6) 8.6271(10) 9.9353(8) 90. 99.262(9) 90.
Vol       417.88
Z          8
Space Group C 1 2/c 1
SG Number 15
Cryst Sys monoclinic
Pearson    mS43
Wyckoff    f4 e3 d
R Value    .0865
Red Cell C  4.939 4.970 9.935 85.412 80.737 60.204 208.942
Trans Red -1.000 0.000 0.000 / -0.500 -0.500 0.000 / 0.000 0.000 1.000
Comments No data on SOF(Li) given; x,y,z(O2) not consistent with
         listed distances
         Total SOF on at least one site differs from unity (SOF <
         0.997 resp. SOF > 1.003)
         The structure has been assigned a PDF number (calculated
         powder diffraction data): 01-085-2001
         Rietveld profile refinement applied
         X-ray diffraction (powder)
Atom  # OX SITE    x          y          z          SOF    H       ITF(U)
Ru 1  +4.6  8 f 0.237(2) 0.0843(8) 0.0012(15)    1.       0       0.17(14)
Li 1  +1 4 d 0.25       0.25       0.5          0.7       0       0.17(14)
Li 2  +1 4 e 0          0.09(6)    0.25          0.7       0       0.17(14)
Li 3  +1 4 e 0          0.41(7)    0.25          0.7       0       0.17(14)
Li 4  +1 4 e 0          0.72(3)    0.25          0.7       0       0.17(14)
O 1  -2 8 f 0.132(11) 0.25(2)    0.120(3)    1.       0       0.17(14)
O 2  -2 8 f 0.122(15) 0.577(1) 0.100(4)    1.       0       0.17(14)
O 3  -2 8 f 0.128(15) 0.923(15) 0.129(4)    1.       0       0.17(14)
*end for ICSD #78722

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franch: 金幣+2, 謝謝回帖交流。。。 2014-04-14 21:29:13

你給出的就是cif文件的格式，直接在MS中打開(kāi)就是。然后3D 操作，你想做什么模型都可以。

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2樓2014-04-13 00:19:00

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引用回帖:

2樓: Originally posted by mywai520 at 2014-04-13 00:19:00
你給出的就是cif文件的格式，直接在MS中打開(kāi)就是。然后3D 操作，你想做什么模型都可以。

那您知道這是一個(gè)有空位的模型，直接導(dǎo)入肯定不能算。也不適合用vca.請(qǐng)教可否具體說(shuō)說(shuō)怎么建空位模型，不惜賜教！

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3樓2014-04-13 09:27:17

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引用回帖:

3樓: Originally posted by small_grass at 2014-04-13 09:27:17
那您知道這是一個(gè)有空位的模型，直接導(dǎo)入肯定不能算。也不適合用vca.請(qǐng)教可否具體說(shuō)說(shuō)怎么建空位模型，不惜賜教！...

你在晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)中導(dǎo)出你要模型的體材料的cif文獻(xiàn)，然后倒入MS，在MS中，你要什么空位，就刪除什么原子。你要間隙的，就在間隙中加入你想加入的原子。若是不會(huì)操作，可以看看MS使用教程。

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4樓2014-04-13 09:44:22

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franch: 金幣+2, 謝謝回帖交流。。。 2014-09-22 22:14:36

不太清楚MS里面如何實(shí)現(xiàn)無(wú)序體系的計(jì)算，不過(guò)abinit軟件里好像能算混合贗勢(shì)，就是能指定一個(gè)格點(diǎn)上占百分之多少的某種元素。

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5樓2014-04-13 15:38:51

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引用回帖:

4樓: Originally posted by mywai520 at 2014-04-13 09:44:22
你在晶體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)中導(dǎo)出你要模型的體材料的cif文獻(xiàn)，然后倒入MS，在MS中，你要什么空位，就刪除什么原子。你要間隙的，就在間隙中加入你想加入的原子。若是不會(huì)操作，可以看看MS使用教程。...

呀，我想您還沒(méi)搞清楚，這個(gè)體系很復(fù)雜，要建一個(gè)超大晶胞，不是刪除那么簡(jiǎn)單。有很多種空位位置，有很多種模型。您可以試一試。

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6樓2014-04-13 16:02:49

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small_grass(fzx2008代發(fā)): 金幣+2, 謝謝回帖！ 2014-04-28 19:27:49

引用回帖:

6樓: Originally posted by small_grass at 2014-04-13 16:02:49
呀，我想您還沒(méi)搞清楚，這個(gè)體系很復(fù)雜，要建一個(gè)超大晶胞，不是刪除那么簡(jiǎn)單。有很多種空位位置，有很多種模型。您可以試一試。...

建立超胞的目的無(wú)非是想模擬空位之間沒(méi)有相互作用，一般十個(gè)A就是可以了。你總不至于在一個(gè)模型中計(jì)算兩個(gè)完全不同的空位對(duì)這個(gè)結(jié)構(gòu)的影響，它們之間還考慮相互作用。那的確很復(fù)雜，但是物理意義卻不是很大。

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7樓2014-04-13 16:07:28

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單純用CASTEP計(jì)算，可以計(jì)算不同空位的總能，來(lái)進(jìn)行判斷。最好是能用蒙特卡洛計(jì)算進(jìn)行模擬，來(lái)得到空位

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8樓2014-09-15 19:00:13

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8樓: Originally posted by cas_hzj at 2014-09-15 19:00:13
單純用CASTEP計(jì)算，可以計(jì)算不同空位的總能，來(lái)進(jìn)行判斷。最好是能用蒙特卡洛計(jì)算進(jìn)行模擬，來(lái)得到空位

謝謝

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9樓2014-09-15 22:52:30

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