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1164028932金蟲 (初入文壇)
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[求助]
materials-studio軟件計算氧氣分子能量。 已有3人參與
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步驟如下： 1、先構(gòu)建一個3D Atomistic文件（即構(gòu)建一個3D物件視窗）；2、在Build——>Crystals——>Build Crystals，這樣就構(gòu)建出了一個立方晶格空間。這個你肯定會。3、Build——>Add Atoms——>選擇O原子，在把xyz坐標(biāo)改為0.5、0.5、0.5，這樣就在立方晶格中央構(gòu)建出了一個O原子，你再用添加原子的筆在那個O原子上加上去一個O原子，就構(gòu)建出了可以計算氧分子能量的模型。4、單獨計算O原子的話，不再添加第二個O原子就行。 計算結(jié)果：我用這種方法算了氧氣分子能量。castep文件中final energy=-866eV，是看這個數(shù)據(jù)嗎？還是看其他的。謝謝了（看別人計算的，還有文獻(xiàn)上給的能量大約都是8~9ev） castep文件： *********************************** Forces *********************************** * * * Cartesian components (eV/A) * * -------------------------------------------------------------------------- * * x y z * * * * O 1 -0.00085 0.00568 -0.00079 * * O 2 0.00085 -0.00568 0.00079 * * * ****************************************************************************** ***************** Stress Tensor ***************** * * * Cartesian components (GPa) * * --------------------------------------------- * * x y z * * * * x -0.018289 0.002225 -0.000730 * * y 0.002225 -0.006909 -0.006006 * * z -0.000730 -0.006006 -0.013130 * * * * Pressure: 0.0128 * * * ************************************************* +------------+-------------+-------------+-----------------+ <-- min BFGS | Step | lambda | F.delta | enthalpy | <-- min BFGS +------------+-------------+-------------+-----------------+ <-- min BFGS | previous | 0.000000 | 0.000000 | -866.417494 | <-- min BFGS | trial step | 1.000000 | 0.000000 | -866.417497 | <-- min BFGS +------------+-------------+-------------+-----------------+ <-- min BFGS BFGS: finished iteration 4 with enthalpy= -8.66417497E+002 eV +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- BFGS | Parameter | value | tolerance | units | OK? | <-- BFGS +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- BFGS | dE/ion | 1.577937E-006 | 5.000000E-006 | eV | Yes | <-- BFGS | |F|max | 5.800782E-003 | 1.000000E-002 | eV/A | Yes | <-- BFGS | |dR|max | 3.427978E-005 | 5.000000E-004 | A | Yes | <-- BFGS | Smax | 1.828935E-002 | 2.000000E-002 | GPa | Yes | <-- BFGS +-----------+-----------------+-----------------+------------+-----+ <-- BFGS BFGS: Geometry optimization completed successfully. ================================================================================ BFGS: Final Configuration: ================================================================================ ------------------------------- Unit Cell ------------------------------- Real Lattice(A) Reciprocal Lattice(1/A) 10.0007554 0.0004342 0.0009489 0.6282711 -0.0000273 -0.0000596 0.0004342 10.0010894 0.0018433 -0.0000273 0.6282501 -0.0001158 0.0009489 0.0018433 10.0034738 -0.0000596 -0.0001158 0.6281004 Lattice parameters(A) Cell Angles a = 10.000755 alpha = 89.978882 b = 10.001090 beta = 89.989128 c = 10.003474 gamma = 89.995024 Current cell volume = 1000.531886 A**3 ------------------------------- Cell Contents ------------------------------- xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx x Element Atom Fractional coordinates of atoms x x Number u v w x x----------------------------------------------------------x x O 1 0.515446 0.528133 0.552192 x x O 2 -0.515446 -0.528133 -0.552192 x xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx BFGS: Final Enthalpy = -8.66417497E+002 eV BFGS: Final <frequency> = 1.14214 cm-1 BFGS: Final bulk modulus unchanged from initial value 結(jié)構(gòu)圖 |
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