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fzhrobin木蟲 (正式寫手)
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[交流]
關(guān)于土壤生物多樣性檢測(cè)的問題 已有5人參與
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想看下不同處理土壤中的微生物群落的多樣性變化，現(xiàn)在都有哪些技術(shù)可用的？除了DGGE和高通量測(cè)序。 以前做過DGGE,但現(xiàn)在有人說過時(shí)了，不知道現(xiàn)在行情怎么樣？ 也不知道DGGE的文章能發(fā)表在什么水平的雜志上？ 還有，高通量測(cè)序似乎很貴，是不是這個(gè)就可以發(fā)檔次比較高的文章呢？ |
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木蟲/panda: 金幣+10, 感謝蟲友交流，說的非常好 2014-04-24 21:20:19
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木蟲/panda: 金幣+10, 感謝蟲友交流，說的非常好 2014-04-24 21:20:19
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能不能發(fā)高水平的文章與實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和發(fā)現(xiàn)有關(guān)系，技術(shù)只是一個(gè)手段而已。 具體而言，DGGE和NGS都是評(píng)價(jià)遺傳多樣性，但是限于價(jià)格，不可能大量的做NGS除非自己有設(shè)備和試劑，而DGGE的分辨率低，一般一個(gè)泳道也就幾十條帶，但是在大量樣品的平行比較中，可以挑選出差異的條帶進(jìn)行分析，可以在遺傳多樣性上做動(dòng)態(tài)的評(píng)價(jià)和分析，也就是做群落動(dòng)力學(xué)。 PLFA和BIOLOG ECO都可以算是代謝多樣性，PLFA可以鑒定到大的種類，如細(xì)菌，真菌等等，優(yōu)點(diǎn)是價(jià)格便宜，分辨率高，缺點(diǎn)是無法鑒定到種屬，只能評(píng)價(jià)宏觀變化。BIOLOG ECO是碳源利用多樣性，這個(gè)在土壤微生物分析中意義其實(shí)很有限。 除此之外，遺傳多樣性上還有克隆文庫(kù)，RFLP，F(xiàn)ISH等等，差點(diǎn)兒忘記了，還有一個(gè)我個(gè)人覺得挺好的ARISA技術(shù)，價(jià)格便宜，分辨率高。 發(fā)文章和你采用的技術(shù)有關(guān)系，但是沒有必然關(guān)系。關(guān)鍵是要有好的科學(xué)或者運(yùn)用的價(jià)值，有核心的科學(xué)或者工程意義！ |
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fzhrobin
5樓2014-04-24 17:33:14
nanjizhou91
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nanjizhou91
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哦 |
6樓2014-04-28 21:05:39
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7樓2014-04-28 21:08:29
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8樓2014-04-29 08:52:05
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9樓2014-04-29 09:06:42
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10樓2014-04-29 09:08:31
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