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fzhrobin木蟲 (正式寫手)
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[交流]
關于土壤生物多樣性檢測的問題 已有5人參與
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想看下不同處理土壤中的微生物群落的多樣性變化，現(xiàn)在都有哪些技術可用的？除了DGGE和高通量測序。 以前做過DGGE,但現(xiàn)在有人說過時了，不知道現(xiàn)在行情怎么樣？ 也不知道DGGE的文章能發(fā)表在什么水平的雜志上？ 還有，高通量測序似乎很貴，是不是這個就可以發(fā)檔次比較高的文章呢？ |
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fzhrobin
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3樓2014-04-23 10:15:49
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
木蟲/panda: 金幣+10, 感謝蟲友交流，說的非常好 2014-04-24 21:20:19
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能不能發(fā)高水平的文章與實驗設計和發(fā)現(xiàn)有關系，技術只是一個手段而已。 具體而言，DGGE和NGS都是評價遺傳多樣性，但是限于價格，不可能大量的做NGS除非自己有設備和試劑，而DGGE的分辨率低，一般一個泳道也就幾十條帶，但是在大量樣品的平行比較中，可以挑選出差異的條帶進行分析，可以在遺傳多樣性上做動態(tài)的評價和分析，也就是做群落動力學。 PLFA和BIOLOG ECO都可以算是代謝多樣性，PLFA可以鑒定到大的種類，如細菌，真菌等等，優(yōu)點是價格便宜，分辨率高，缺點是無法鑒定到種屬，只能評價宏觀變化。BIOLOG ECO是碳源利用多樣性，這個在土壤微生物分析中意義其實很有限。 除此之外，遺傳多樣性上還有克隆文庫，RFLP，F(xiàn)ISH等等，差點兒忘記了，還有一個我個人覺得挺好的ARISA技術，價格便宜，分辨率高。 發(fā)文章和你采用的技術有關系，但是沒有必然關系。關鍵是要有好的科學或者運用的價值，有核心的科學或者工程意義！ |
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fzhrobin5樓2014-04-24 17:33:14
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