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cyx0516木蟲 (正式寫手)
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plat331,420,417,245,checkcif的A類和B類錯誤 已有2人參與
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請各位幫忙解決這幾個A類和B類錯誤 PLAT331_ALERT_2_B Small Average Phenyl C-C Dist. C22 -C27 1.35 Ang. PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O11 - H11C ... Please Check PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D H29C .. H29C .. 1.57 Ang. PLAT245_ALERT_2_B U(iso) H29C Smaller than U(eq) O29 by ... 0.062 AngSq |
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| 從你這幾個錯誤來看,數(shù)據(jù)好像不是太好,第一個可以通過dfix命令解決,如果1.38不行的話,你可以試試1.40;第二個問題可以不用解決,某些官能團不能形成氫鍵也很正常;第三個問題是O29上的H29c和本身對稱操作的H29c距離太近,這個問題可能是你加氫有問題,也可能是氫原子的個數(shù)不對,比如O29上沒有氫,具體要看結(jié)構(gòu);第四個問題是你的H也按異性精修了,應(yīng)該修各項同性,限制其Ueq為-1.5000。 |
木蟲 (正式寫手)
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木蟲 (正式寫手)
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