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cyx0516木蟲 (正式寫手)
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[求助]
plat331,420,417,245,checkcif的A類和B類錯誤 已有2人參與
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請各位幫忙解決這幾個A類和B類錯誤 PLAT331_ALERT_2_B Small Average Phenyl C-C Dist. C22 -C27 1.35 Ang. PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O11 - H11C ... Please Check PLAT417_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-D H29C .. H29C .. 1.57 Ang. PLAT245_ALERT_2_B U(iso) H29C Smaller than U(eq) O29 by ... 0.062 AngSq |
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jackdeng
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cyx0516: 金幣+10 2014-04-28 11:54:34
| 從你這幾個錯誤來看，數(shù)據(jù)好像不是太好，第一個可以通過dfix命令解決，如果1.38不行的話，你可以試試1.40；第二個問題可以不用解決，某些官能團不能形成氫鍵也很正常；第三個問題是O29上的H29c和本身對稱操作的H29c距離太近，這個問題可能是你加氫有問題，也可能是氫原子的個數(shù)不對，比如O29上沒有氫，具體要看結(jié)構(gòu)；第四個問題是你的H也按異性精修了，應(yīng)該修各項同性，限制其Ueq為-1.5000。 |
3樓2014-04-25 22:13:39
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2樓2014-04-25 15:06:17
cyx0516
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4樓2014-04-28 11:54:10
jackdeng
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5樓2014-04-28 13:25:03
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