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板橋霜木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
求助--Openmpi-1.8集群編譯問(wèn)題 已有2人參與
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各位大俠，本人純屬菜鳥(niǎo)，最近出于好奇，愛(ài)好，興趣。。。。。搞了幾臺(tái)臺(tái)古董，想自己搭建集群，怎奈基礎(chǔ)不牢，從開(kāi)始到現(xiàn)在快兩個(gè)周了，還沒(méi)有成功，廢話不多說(shuō)，上問(wèn)題，忘各位不吝賜教。 硬件環(huán)境：1臺(tái)浪潮服務(wù)器：2個(gè)CPU，兩核，Intel Xeon 2.4GHz. 2臺(tái)并行機(jī)，1個(gè)CPU，Pentium D 3.4GHz，1000M交換機(jī)。 軟件：redhat linux 6.2，Intel l_fcompcxe_2013_sp1.2.144 & l_ccompcxe_3013_sp1.2.144, Openmpi-1.8，目標(biāo)是并行編譯安裝vasp5.2，實(shí)現(xiàn)并行運(yùn)算。 目前進(jìn)行到單機(jī)并行編譯VASP，運(yùn)算沒(méi)有問(wèn)題，但是無(wú)法實(shí)現(xiàn)集群并行運(yùn)算。我感覺(jué)問(wèn)題出現(xiàn)在Openmpi上，經(jīng)過(guò)我自己的測(cè)試，編譯Openmpi用以下指令： ./configure --prefix=/usr/local/openmpi-1.8 FC=/opt/intel/bin/ifort CC=/opt/intel/bin/icc CXX=/opt/intel/bin/cipc make make install 后測(cè)試運(yùn)行hello_c 結(jié)果： hello, world, I am 0 of 2,..... hello, world, I am 1 of 2,.... 如果修改openmpi-default-hostfile添加各節(jié)點(diǎn)； LAB-P1 slots=1 LAB-P2 slots=2 運(yùn)行測(cè)試 mpirun hello_c 得到結(jié)果如下： bash: orted: command not found bash: orted: command not found 請(qǐng)問(wèn)各位大俠，是我的openmpi 沒(méi)有編譯對(duì)嗎？如果是，問(wèn)題出在哪？我該怎么做？如果不是又該怎么處理呢？ 謝謝！ |
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 VASP and MS |
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mywai520
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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問(wèn)一句，你的兩臺(tái)機(jī)器做了共享NFS服務(wù)否，還有吉他相關(guān)集群設(shè)置問(wèn)題�？梢詤⒖家幌挛乙郧白龃罱ㄗ龅囊恍┕P記: http://vasp1860.blog.edu.cn/home ... g&id=159741 |
2樓2014-04-27 20:48:58
板橋霜
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3樓2014-04-27 21:49:37
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4樓2014-04-27 21:55:20
mywai520
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5樓2014-04-27 21:59:38
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6樓2014-04-27 22:18:11
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mpi并行軟件有幾種：mpich2 mpich openmpi intel-mpi Hp-mpi 但是基本都是一樣，只是開(kāi)發(fā)者不同而已�，F(xiàn)在多用openmpi，因?yàn)槭情_(kāi)源的。但是跟mipch或者mpich2區(qū)別不大，其實(shí)根本就沒(méi)有區(qū)別。都是mpi,用來(lái)做并行計(jì)算的代碼。 你現(xiàn)在的問(wèn)題，不是集群裝個(gè)MPI就能并行了。需要設(shè)置磁盤(pán)共享，網(wǎng)絡(luò)共享，數(shù)據(jù)同步等相關(guān)服務(wù)。裝mpi只是給你提供一個(gè)并行服務(wù)，并不能在沒(méi)有前面相關(guān)支持下就能兩臺(tái)不相干的機(jī)器就能并行。 |
7樓2014-04-27 22:26:12
chuanghua304
禁蟲(chóng) (職業(yè)作家)
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8樓2014-04-27 22:31:17
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9樓2014-04-27 22:48:31
板橋霜
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10樓2014-04-27 23:04:28
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