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至尊木蟲 (職業(yè)作家)

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[求助] PCM模型求助已有4人參與

計(jì)算用PCM模型，溶劑用乙酸酐，但Gaussian 09默認(rèn)的溶劑里面沒有乙酸酐，因此照說明書里的進(jìn)行自定義,輸入文件如下：
%mem=1500mb
%chk=L4-PCM2
#p  b3lyp/6-311++g** opt freq 5D SCRF=(SMD,Solvent=Generic,PCM=Read) nosymm

L4-PCM2

0 1
6          0    -4.086788 1.164831 -0.001087
6          0    -4.000176 -0.249678 -0.006797
7          0    -2.831932 -0.889750 -0.007595
6          0    -1.713552 -0.162361 -0.002777
6          0    -1.661624 1.252053 0.003164
6          0    -2.920554 1.892355 0.003773
7          0    -5.125477 -1.024625 -0.011694
7          0    -0.512554 -0.858557 -0.003727
6          0       0.721810 -0.211941 0.000938
6          0       0.759503 1.206613 0.006901
6          0    -0.392222 1.942626 0.008090
6          0    -0.320638 -2.234223 -0.009061
6          0       1.028195 -2.464786 -0.007804
6          0       1.712850 -1.207903 -0.001522
6          0       3.154449 -0.967357 0.001861
8          0       3.631530 0.162924 0.007240
6          0       4.068017 -2.183960 -0.001425
6          0    -0.348792 3.448367 0.014450
1          0    -5.052909 1.655368 -0.000589
1          0    -2.969196 2.974461 0.008126
1          0    -5.026303 -2.025444 -0.015939
1          0    -6.044377 -0.620813 -0.012039
1          0       1.736499 1.669112 0.010425
1          0    -1.166074 -2.898116 -0.013174
1          0       1.484174 -3.442671 -0.011091
1          0       5.104004 -1.848064 0.001718
1          0       3.885948 -2.809168 0.877958
1          0       3.889014 -2.802117 -0.886404
1          0       0.683525 3.799507 0.017543
1          0    -0.847278 3.862946 0.897337
1          0    -0.844473 3.870368 -0.866500

stoichiometry=C4H6O3
solventname=Ethanoyl ethanoate
eps=21.00
epsinf=1.9329

運(yùn)行后報(bào)錯(cuò)如下：QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
D,Solvent=Generic,PCM=Read) nosymm
                  '
Last state="SCR2"
TCursr=63935 LCursr= 61
Error termination via Lnk1e in F:\G09W\l1.exe at Sun Apr 27 14:52:47 2014.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    1 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1
不知道是什么原因，我實(shí)在看不出來，求高手幫幫忙，看看錯(cuò)在哪里？或者告訴我用乙酸酐作溶劑要怎么寫？非常感謝！

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1樓 2014-04-27 20:17:27

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gougaozhan: 金幣+5 2014-04-27 21:10:27

官網(wǎng)上現(xiàn)在例子的寫法改成SCRF=(SMD,Solvent=Generic,Read)，這樣就可以了。
貌似是因?yàn)檎f明書是老舊的，G09的語法有所改變。

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2樓2014-04-27 21:01:48

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2樓: Originally posted by alexwpch at 2014-04-27 21:01:48
官網(wǎng)上現(xiàn)在例子的寫法改成SCRF=(SMD,Solvent=Generic,Read)，這樣就可以了。
貌似是因?yàn)檎f明書是老舊的，G09的語法有所改變。

我的及尺這樣寫的，但是一算就錯(cuò)，不知道什么原因

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3樓2014-04-27 21:10:19

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3樓: Originally posted by gougaozhan at 2014-04-27 21:10:19
我的及尺這樣寫的，但是一算就錯(cuò)，不知道什么原因...

打錯(cuò)字，看不懂。
你的那個(gè)寫法多了"PCM=",請(qǐng)看仔細(xì)了�？赡蹽09的寫法改變了，但是說明書還沒來及修改，所以你用舊的寫法會(huì)報(bào)錯(cuò)。

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4樓2014-04-28 07:47:30

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3樓: Originally posted by gougaozhan at 2014-04-27 21:10:19
我的及尺這樣寫的，但是一算就錯(cuò)，不知道什么原因...

2樓的方法是可以算的。仔細(xì)查看說明書，SMD和Read都是PCM的選項(xiàng)，他們的優(yōu)先級(jí)應(yīng)該一樣，那為何SMD可以寫在scrf下面，而read卻要再寫在pcm下面呢？可能是說明書的一個(gè)bug。至于你說的還是一算就錯(cuò)，不知道具體出錯(cuò)原因是否還是輸入問題？

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5樓2014-04-28 08:08:54

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5樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2014-04-28 08:08:54
2樓的方法是可以算的。仔細(xì)查看說明書，SMD和Read都是PCM的選項(xiàng)，他們的優(yōu)先級(jí)應(yīng)該一樣，那為何SMD可以寫在scrf下面，而read卻要再寫在pcm下面呢？可能是說明書的一個(gè)bug。至于你說的還是一算就錯(cuò)，不知道具體出錯(cuò) ...

Gaussian官網(wǎng)的例子：
# B3LYP/6-31G(d) 5D SCRF(SMD,Solvent=Generic,Read)

Water, solvation by methanol, re-defined as generic solvent.

0 1
O
H,1,0.94
H,1,0.94,2,104.5

stoichiometry=C1H4O1 Input section for PCM keywords
solventname=methanol
eps=32.63
epsinf=1.758
…
Blank line terminates PCM input
我的就照這個(gè)寫，不知道錯(cuò)在那了

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6樓2014-04-28 10:29:02

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4樓: Originally posted by alexwpch at 2014-04-28 07:47:30
打錯(cuò)字，看不懂。
你的那個(gè)寫法多了"PCM=",請(qǐng)看仔細(xì)了�？赡蹽09的寫法改變了，但是說明書還沒來及修改，所以你用舊的寫法會(huì)報(bào)錯(cuò)。...

不好意思，寫著急了。我去了"PCM=",然后運(yùn)行，但是也出錯(cuò)，錯(cuò)誤提示如下：請(qǐng)幫忙看看，謝謝！
The following wrong keyword(s) have been found:
ETHANOATE
------------------------------------------------------------------------------
Error termination via Lnk1e in F:\G09W\l301.exe at Mon Apr 28 10:30:25 2014.
Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 2.0 seconds.
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7樓2014-04-28 10:32:57

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我搞定了，溶劑名我就用漢語拼音就不報(bào)錯(cuò)了，謝謝

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8樓2014-04-28 10:36:39

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首先，關(guān)鍵詞SCRF=(SMD,Solvent=Generic,Read)，說明書上那個(gè)例子的確有問題；

其次，你的溶劑定義“solventname=Ethanoyl ethanoate”中出現(xiàn)空格，Gaussian會(huì)讀取“solventname=Ethanoyl”部分，然后將“ethanoate”認(rèn)為是多余關(guān)鍵詞。你在solventname后面定義的時(shí)候沒有空格就行了。

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9樓2014-04-28 11:00:26

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5樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2014-04-27 12:08:54
2樓的方法是可以算的。仔細(xì)查看說明書，SMD和Read都是PCM的選項(xiàng)，他們的優(yōu)先級(jí)應(yīng)該一樣，那為何SMD可以寫在scrf下面，而read卻要再寫在pcm下面呢？可能是說明書的一個(gè)bug。至于你說的還是一算就錯(cuò)，不知道具體出錯(cuò) ...

SMD和Read都是PCM的選項(xiàng)?
笑死了

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10樓2014-04-28 13:01:53

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