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duanepp木蟲 (小有名氣)
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[交流]
migrate-n 軟件使用的一些困惑
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關(guān)于migrate軟件的疑問 1.我的數(shù)據(jù)格式為微衛(wèi)星，選擇data type時選擇哪種？ 2.選擇搜索策略是為Bayesian Inference 第八項 long chain 為1 第九項 sampling increment設(shè)置為多少 第十項 record steps in chain設(shè)置為多少 第十一項 burn-in of each chain設(shè)置為多少 第十二項replicates設(shè)置為多少 3.第十三項 heating migrate的3.6.4版中heating scheme中刪除了adaptive選項，這里該選擇什么？static？ 4.再選擇static后 different heated chain 設(shè)置為4（？），然后swapping tree 設(shè)置為1（？） 在3.2.15中設(shè)置coldest temperature中的例子為1.0 1.5 3 0 6.0，而3.6.4版中為1.0 1.5 3.0 1000000.0，這個地方如何設(shè)置？ 5. migrate要計算四次，第一次Theta和M值是由FST計算得到，后面的三次是如何得到和設(shè)置的 |
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2014-04-28 14:53:36, 63.5 K
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