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小蟲(chóng)_sang鐵蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
對(duì)于分子數(shù)較多的周期性結(jié)構(gòu)的優(yōu)化問(wèn)題 已有2人參與
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對(duì)一個(gè)一維無(wú)限長(zhǎng)納米管結(jié)構(gòu)進(jìn)行優(yōu)化,由于周期內(nèi)結(jié)構(gòu)原子數(shù)目龐大(336個(gè)原子),我的思路是:先用Forcite中的力場(chǎng)進(jìn)行幾何優(yōu)化,然后再用Dmol3優(yōu)化,有兩個(gè)問(wèn)題請(qǐng)教一下各位大神: 1、用Forcite力場(chǎng)優(yōu)化時(shí)是不是只選擇一個(gè)合適的力場(chǎng)然后“Geometry Optimization”就行了,不需要跑動(dòng)力學(xué)吧? 2、在用Dmol3優(yōu)化前是不是需要用Forcite優(yōu)化好的結(jié)構(gòu)中的力場(chǎng)退掉?還有怎么退力場(chǎng)?不退力場(chǎng)的話(huà)在接下來(lái)的優(yōu)化中會(huì)有什么影響嗎? 先謝謝了,,,非常感謝指點(diǎn) |
木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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1. 沒(méi)用過(guò)forcite,但是應(yīng)該只做OPT就可以 2.dmol不會(huì)讀去forcite的立力場(chǎng),會(huì)用DFT的方法重新進(jìn)行優(yōu)化。所以這個(gè)問(wèn)題不存在,把上一個(gè)結(jié)構(gòu)讀過(guò)來(lái)就行了。 還有個(gè)問(wèn)題是你準(zhǔn)備怎么優(yōu)化晶格常數(shù)呢,還是就用實(shí)驗(yàn)值? |
專(zhuān)家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
小才
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專(zhuān)家經(jīng)驗(yàn): +52 |

鐵蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
鐵蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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