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robertslim金蟲 (小有名氣)
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[求助]
過渡態(tài)計(jì)算求助？ 已有2人參與
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最近求一個(gè)親核反應(yīng)的過渡態(tài)，我用次氯根離子和六氟丙烯作為反應(yīng)物一起優(yōu)化的時(shí)候，優(yōu)化完成之后直接氧原子直接和碳原子連在一起，成反應(yīng)物六氟環(huán)氧丙烷和氯離子了，即使我在優(yōu)化前把次氯酸跟離子跟六氟丙烯放很遠(yuǎn)都不管用��！是不是雙分子反應(yīng)物不能放在一起優(yōu)化，跪求各位大俠給點(diǎn)建議？是不是我的方法不對(duì)。最近大論文想加點(diǎn)機(jī)理方面的東西，愁死了 反應(yīng)機(jī)理.jpg |
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| 一般雙分子反應(yīng)里的兩種反應(yīng)物需要分開優(yōu)化，過渡態(tài)肯定是要在一個(gè)結(jié)構(gòu)里。優(yōu)化不成功的原因有很多，需要慢慢找�？戳艘幌履憬o的示意圖，反應(yīng)是一個(gè)加成然后解離的過程，第一個(gè)加成產(chǎn)物的形成可能是沒有過渡態(tài)的，建議你先尋找一下第一步的加成產(chǎn)物。 |
robertslim2樓2014-05-07 17:55:23
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4樓2014-05-07 19:56:31
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| 雙分子反應(yīng)是要放在一個(gè)體系中優(yōu)化的，首先，將反應(yīng)物A和B分別優(yōu)化，然后，再將兩個(gè)分子放在一個(gè)窗口中優(yōu)化，另外，使用QST2的話，A+B=C可能會(huì)出錯(cuò)，系統(tǒng)會(huì)提醒使用QST3，所以還是先猜出過渡態(tài)在計(jì)算的好。輸入文件要注意電荷及自旋多重度，計(jì)算過渡態(tài)時(shí)輸入坐標(biāo)最好不要用三維（xyz）坐標(biāo)，易出錯(cuò)。 |
6樓2014-05-08 09:23:26
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8樓2014-05-08 10:57:13
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