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[求助]
Normfinder數(shù)據(jù)輸入緊急求助！ 已有1人參與
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| 各位前輩們你們好，小弟最近在用Normfinder進行內(nèi)參篩選，但是對于其數(shù)據(jù)的輸入處理不是很清楚，我看一些資料上說是將技術(shù)重復(fù)的3個CT值求幾何平均數(shù)，然后在進行什么對數(shù)轉(zhuǎn)換，沒看明白，2004年的那篇文章的例子我也拿來走了一遍，但是他的原始輸入數(shù)據(jù)都是5位數(shù)左右，我就想知道這數(shù)據(jù)是怎樣根據(jù)CT值算得的。希望學(xué)長們不吝賜教，小弟跪謝了！ |
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忘憂草_
木蟲 (正式寫手)
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- 專業(yè): 植物化學(xué)保護
2樓2014-06-11 16:54:38
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
寂寞又美好(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+3, 鼓勵回帖交流 2014-06-11 18:56:03
寂寞又美好(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+3, 鼓勵回帖交流 2014-06-11 18:56:03
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推薦你去看看這篇文獻 Andersen CL, Jensen JJ, Ørntoft TF (2004) Normalization of real-time quantitative reverse transcription-PCR data: a model-based variance estimation approach to identify genes suited for normalization, applied to bladder and colon cancer data sets. Cancer Res 64:5245-5250 是需要將平均CT值轉(zhuǎn)換成相對值，就是用組合里面最小的CT值去和任何一個值進行比較，得到轉(zhuǎn)換的相對值，然后在進行相應(yīng)的計算。這篇文獻介紹得非常清楚的。具體的步驟我也忘記了，因為我11年做過，這幾年都沒有做了的哈！ |
3樓2014-06-11 17:15:59
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