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zhanghuayi

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[求助] 數(shù)學構(gòu)建螺旋的問題已有1人參與

數(shù)學構(gòu)建螺旋模型：根據(jù)教程構(gòu)建好一個EXCEL文件數(shù)據(jù)后保存為txt文件，但是如何用Daimond打開啊。教程里面說用Diamond打開xyz文件即可，我打開了幾次都沒成功啊。教程上這樣說：

我們在 excel 中建立系列數(shù)據(jù)。列成四列：
C1 X1 Y1 Z1
C1 X2 Y2 Z2
。。。。。
另存為.txt 文件,用寫字板打開文件，然后在最前面加上一個簡單描述
169（數(shù)字可變）
Luoxuan（名稱可變）; Picture 1
保存為 Luoxuan.txt，用 diamond 中的打開時選擇 XYZ 格式文件，即可。

我構(gòu)建好了數(shù)據(jù)是txt文件的，但是打不開。沮喪。。

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1樓 2014-05-22 14:37:03

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calebby

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

第一行的數(shù)字是指的總共含有的原子數(shù)目，第二列可以不填，最后直接把.txt重命名為.xyz，然后就可以用diamond打開，樓主再試試看。

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2樓2014-05-22 15:04:49

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zhanghuayi

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引用回帖:

2樓: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:04:49
第一行的數(shù)字是指的總共含有的原子數(shù)目，第二列可以不填，最后直接把.txt重命名為.xyz，然后就可以用diamond打開，樓主再試試看。

我構(gòu)建了這樣的數(shù)據(jù)，但是重命名xyz格式后依然打不開呀�？梢运搅膯�？
169
c                   x                   y                   z
0.022222222 0.5                   0.5                   0
0.022222222 0.534729636 0.696961551 0.022222222
0.022222222 0.568404029 0.687938524 0.044444444
0.022222222 0.6                   0.673205081 0.066666667
0.022222222 0.628557522 0.653208889 0.088888889
0.022222222 0.653208889 0.628557522 0.111111111
0.022222222 0.673205081 0.6                   0.133333333
0.022222222 0.687938524 0.568404029 0.155555556
0.022222222 0.696961551 0.534729636 0.177777778
0.022222222 0.7                   0.5                   0.2

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3樓2014-05-22 15:12:44

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calebby

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3樓: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-22 15:12:44
我構(gòu)建了這樣的數(shù)據(jù)，但是重命名xyz格式后依然打不開呀�？梢运搅膯幔�
169
c x y z
0.022222222 0.5 0.5 0
0.022222222 0. ...

你的格式錯了，應(yīng)該是這樣的：
10(所含原子的數(shù)目)
***（可以不填）
C X1 Y1 Z1（第一列為元素種類，后三列為坐標）
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****

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4樓2014-05-22 15:24:19

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zhanghuayi

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5樓2014-05-22 22:37:34

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4樓: Originally posted by calebby at 2014-05-22 15:24:19
你的格式錯了，應(yīng)該是這樣的：
10(所含原子的數(shù)目)
***（可以不填）
C X1 Y1 Z1（第一列為元素種類，后三列為坐標）
C X2 Y2 Z2
C X3 Y3 Z3
****
****...

還是不成功。我構(gòu)建了一個數(shù)據(jù)文件，請幫忙轉(zhuǎn)修改成Diamond。

101

C 0.5          0.5          0
C 0.534729636    0.696961551    0.022222222
C 0.568404029    0.687938524    0.044444444
C 0.6          0.673205081    0.066666667
C 0.628557522    0.653208889    0.088888889
C 0.653208889    0.628557522    0.111111111
C 0.673205081    0.6          0.133333333
C 0.687938524    0.568404029    0.155555556
C 0.696961551    0.534729636    0.177777778
C 0.7          0.5          0.2
C 0.696961551    0.465270364    0.222222222
C 0.687938524    0.431595971    0.244444444
C 0.673205081    0.4          0.266666667
C 0.653208889    0.371442478    0.288888889
C 0.628557522    0.346791111    0.311111111
C 0.6          0.326794919    0.333333333
C 0.568404029    0.312061476    0.355555556
C 0.534729636    0.303038449    0.377777778
C 0.5          0.3          0.4
C 0.465270364    0.303038449    0.422222222
C 0.431595971    0.312061476    0.444444444
C 0.687938524    0.326794919    0.466666667
C 0.371442478    0.346791111    0.488888889
C 0.346791111    0.371442478    0.511111111
C 0.326794919    0.4          0.533333333
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C 0.3          0.5          0.6
C 0.303038449    0.534729636    0.622222222
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C 0.326794919    0.6          0.666666667
C 0.346791111    0.628557522    0.688888889
C 0.371442478    0.653208889    0.711111111
C 0.4          0.673205081    0.733333333
C 0.431595971    0.687938524    0.755555556
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C 0.534729636    0.696961551    0.822222222
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C 0.6          0.673205081    0.866666667
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C 0.653208889    0.628557522    0.911111111
C 0.673205081    0.6          0.933333333
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C 0.687938524    0.431595971    1.044444444
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C 0.346791111    0.371442478    1.311111111
C 0.326794919    0.4          1.333333333
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C 0.312061476    0.568404029    1.444444444
C 0.326794919    0.6          1.466666667
C 0.346791111    0.628557522    1.488888889
C 0.371442478    0.653208889    1.511111111
C 0.4          0.673205081    1.533333333
C 0.431595971    0.687938524    1.555555556
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C 0.5          0.7          1.6
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C 0.431595971    0.312061476    2.044444444
C 0.4          0.326794919    2.066666667
C 0.371442478    0.346791111    2.088888889
C 0.346791111    0.371442478    2.111111111
C 0.326794919    0.4          2.133333333
C 0.312061476    0.431595971    2.155555556
C 0.303038449    0.465270364    2.177777778
C 0.3          0.5          2.2
C 0.303038449    0.534729636    2.222222222

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6樓2014-05-23 13:58:52

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還是不成功。我構(gòu)建了一個數(shù)據(jù)文件，請幫忙轉(zhuǎn)修改成Diamond。

101

C 0.5          0.5          0
C 0.534729636    0.696961551    0.022222222
C 0.568404029    0.687938524    0.044444444
C 0.6          0.6 ...

你的這一段是沒有問題的，全部復(fù)制粘貼到txt文檔中，保存，改名為.xyz，用diamond打開，刪除掉所有的鍵就成了。方法都告訴你了，遇到了一點小麻煩難道不能自己再摸索摸索？

11.jpg

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7樓2014-05-23 14:36:34

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zhanghuayi

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引用回帖:

7樓: Originally posted by calebby at 2014-05-23 14:36:34
你的這一段是沒有問題的，全部復(fù)制粘貼到txt文檔中，保存，改名為.xyz，用diamond打開，刪除掉所有的鍵就成了。方法都告訴你了，遇到了一點小麻煩難道不能自己再摸索摸索？

11.jpg
...

ictory: 謝謝。不要這么兇。

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沒有捷徑，只有經(jīng)營

8樓2014-05-23 16:17:12

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zhanghuayi

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再問一哈，在Diamond里面點擊了connectivity后，設(shè)置里面怎么設(shè)置啊，整了幾回都不成功。

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回復(fù)此樓

沒有捷徑，只有經(jīng)營

9樓2014-05-23 16:44:24

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calebby

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【答案】應(yīng)助回帖

引用回帖:

9樓: Originally posted by zhanghuayi at 2014-05-23 16:44:24
再問一哈，在Diamond里面點擊了connectivity后，設(shè)置里面怎么設(shè)置啊，整了幾回都不成功。

你把所有的鍵都刪除后，直接設(shè)置原子大小，把原子半徑設(shè)置為一個比較合適的大小，不用成鍵。具體的效果見我上面的那張圖。

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回復(fù)此樓

10樓2014-05-23 17:28:48

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