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種群遺傳分化與遺傳結(jié)構(gòu)：FST與STRUCTURE分析結(jié)果不一致！ 已有1人參與
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各位蟲友好， 本人在一項(xiàng)種群遺傳遺傳學(xué)研究中遇到以下問題： 我們用微衛(wèi)星標(biāo)記研究了4個(gè)種群（A、B、C、D）的遺傳分化與遺傳結(jié)構(gòu)。 Arlequin軟件分析的FST結(jié)果顯示A、B、C三個(gè)種群間都有極顯著的遺傳分化（p<0.001）， 但基于Bayesian聚類分析（STRUCTURE軟件）的結(jié)果則顯示：A-B聚為一個(gè)遺傳簇，C-D聚為另一個(gè)遺傳簇。 主要疑問在于 FST分析顯示：A與B間存在極顯著的遺傳分化， 而STRUCTURE軟件則顯示：A-B聚在一起，也就是說A與B之間沒有顯著的遺傳分化。 這是為什么呢？ |
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hechuguiqu11
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2樓2014-06-16 10:07:41
單子3樓2014-06-22 20:53:07
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
單子(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2014-07-05 19:09:32
單子(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+2, 鼓勵(lì)回帖交流 2014-07-05 19:09:32
| 這個(gè)問題我也遇到過，比你更氣人的是，我用兩個(gè)軟件出來的聚類圖還不一樣！我導(dǎo)師當(dāng)時(shí)給我的理由是，軟件內(nèi)部的具體參數(shù)不同，檢驗(yàn)方法也不不同（相信你遇到過不同檢驗(yàn)方法差異很大的情況）。所以我們根據(jù)自己的側(cè)重點(diǎn)選擇就行，畢竟不是學(xué)數(shù)學(xué)的，那些原理都不同！ |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
4樓2014-06-26 14:02:03
5樓2014-07-05 15:25:42
6樓2014-07-05 15:26:42
7樓2014-07-05 15:26:55
李少珂
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8樓2014-08-26 18:26:50
zhaoxiaobi
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10樓2017-03-04 20:39:56
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