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種群遺傳分化與遺傳結(jié)構(gòu):FST與STRUCTURE分析結(jié)果不一致! 已有1人參與
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各位蟲(chóng)友好, 本人在一項(xiàng)種群遺傳遺傳學(xué)研究中遇到以下問(wèn)題: 我們用微衛(wèi)星標(biāo)記研究了4個(gè)種群(A、B、C、D)的遺傳分化與遺傳結(jié)構(gòu)。 Arlequin軟件分析的FST結(jié)果顯示A、B、C三個(gè)種群間都有極顯著的遺傳分化(p<0.001), 但基于Bayesian聚類(lèi)分析(STRUCTURE軟件)的結(jié)果則顯示:A-B聚為一個(gè)遺傳簇,C-D聚為另一個(gè)遺傳簇。 主要疑問(wèn)在于 FST分析顯示:A與B間存在極顯著的遺傳分化, 而STRUCTURE軟件則顯示:A-B聚在一起,也就是說(shuō)A與B之間沒(méi)有顯著的遺傳分化。 這是為什么呢? |
銅蟲(chóng) (小有名氣)
| 這個(gè)問(wèn)題我也遇到過(guò),比你更氣人的是,我用兩個(gè)軟件出來(lái)的聚類(lèi)圖還不一樣!我導(dǎo)師當(dāng)時(shí)給我的理由是,軟件內(nèi)部的具體參數(shù)不同,檢驗(yàn)方法也不不同(相信你遇到過(guò)不同檢驗(yàn)方法差異很大的情況)。所以我們根據(jù)自己的側(cè)重點(diǎn)選擇就行,畢竟不是學(xué)數(shù)學(xué)的,那些原理都不同! |
銅蟲(chóng) (初入文壇)
新蟲(chóng) (初入文壇)

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