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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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cenwanglai

榮譽版主 (知名作家)

老和山猥瑣派九段

應(yīng)助: 46 (小學(xué)生)
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專業(yè): 理論和計算化學(xué)
管轄: 仿真模擬

[求助] 經(jīng)典分子動力學(xué)軟件DL_POLY結(jié)構(gòu)優(yōu)化優(yōu)化的是什么？

做好結(jié)構(gòu)后，先做結(jié)構(gòu)優(yōu)化，CONTROL中寫optim forces 0.2
很快就收斂了（timestep = 3~10）.

現(xiàn)在問題是：FIELD中規(guī)定了分子內(nèi)的鍵長，比如規(guī)定CO分子鍵長為1.2埃，初始結(jié)構(gòu)CONFIG中設(shè)置C-O鍵長為1.5埃。做包含1000個CO分子的結(jié)構(gòu)，在常溫常壓下結(jié)構(gòu)優(yōu)化。第二步就會把C-O鍵長優(yōu)化到1.2埃？

結(jié)構(gòu)優(yōu)化應(yīng)該是優(yōu)化分子鍵的相互作用距離？或者對于大分子，優(yōu)化分子的卷曲結(jié)構(gòu)，而不是成鍵原子之間的鍵長？

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1樓 2014-05-28 22:28:16

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