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nbashibo鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
分子標記直接確定目標基因的有無 已有1人參與
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如題，根據(jù)已克隆基因設計一段引物，以后能否根據(jù)此引物擴增條帶的有無直接判斷目標基因的有無；如果不可以，有什么其他的便捷方法？ 謝謝 |
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nwsuafliu
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【答案】應助回帖
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木蟲/panda: 金幣+3, 感謝應助，歡迎常來農(nóng)林版 2014-05-29 22:42:05
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答案是YES。根據(jù)已克隆的基因序列設計引物，作為分子標記，當然可以判斷該基因在目標材料中的有無。在知道功能位點的情況下，據(jù)此設計的引物實際上就是功能標記。 當然，實際情形下，要稍微復雜一些。有的標記是顯性的，擴增結果就是有、無之分。更多的標記是共顯性的，擴增條帶有大小之分。還有的情形是，你能擴增出同樣大小的帶型，卻未必代表相同的等位基因，因為在擴增片段中間可能存在功能性SNP位點的差異。 |
2樓2014-05-29 22:40:37
nbashibo
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3樓2014-05-30 09:43:24
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4樓2014-05-30 09:51:18
nwsuafliu
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【答案】應助回帖
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水稻白葉枯或者稻瘟病的抗性基因已經(jīng)有很多報道。稍微找一下就可以找到很多文獻的。 最簡單的是到www.ricedata.cn上查找。里面有一欄“基因&QTL"，進去以后，可以根據(jù)基因名稱、符號或登錄號進行檢索。輸入Xa，點擊檢索，可以得到大部分的白葉枯病抗性基因，那些打勾的都是已經(jīng)克隆的基因，繼續(xù)點擊進去就可以看到相關的基因符號和原始文獻。輸入Pi，點擊檢索，可以查到大部分的稻瘟病抗性基因。 至于您問的問題，實際上也沒有復雜。如果有相同大小的條帶，一般認為是相同的allele。除非你知道那里有snp，才會去測序或者酶切驗證其異同。 |
5樓2014-05-30 23:04:01
nwsuafliu
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6樓2014-05-30 23:08:35
nbashibo
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7樓2014-05-31 11:40:54
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