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nbashibo鐵蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
分子標(biāo)記直接確定目標(biāo)基因的有無(wú) 已有1人參與
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如題，根據(jù)已克隆基因設(shè)計(jì)一段引物，以后能否根據(jù)此引物擴(kuò)增條帶的有無(wú)直接判斷目標(biāo)基因的有無(wú)；如果不可以，有什么其他的便捷方法？ 謝謝 |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
木蟲(chóng)/panda: 金幣+3, 感謝應(yīng)助，歡迎常來(lái)農(nóng)林版 2014-05-29 22:42:05
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答案是YES。根據(jù)已克隆的基因序列設(shè)計(jì)引物，作為分子標(biāo)記，當(dāng)然可以判斷該基因在目標(biāo)材料中的有無(wú)。在知道功能位點(diǎn)的情況下，據(jù)此設(shè)計(jì)的引物實(shí)際上就是功能標(biāo)記。 當(dāng)然，實(shí)際情形下，要稍微復(fù)雜一些。有的標(biāo)記是顯性的，擴(kuò)增結(jié)果就是有、無(wú)之分。更多的標(biāo)記是共顯性的，擴(kuò)增條帶有大小之分。還有的情形是，你能擴(kuò)增出同樣大小的帶型，卻未必代表相同的等位基因，因?yàn)樵跀U(kuò)增片段中間可能存在功能性SNP位點(diǎn)的差異。 |
2樓2014-05-29 22:40:37
nbashibo
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3樓2014-05-30 09:43:24
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4樓2014-05-30 09:51:18
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【答案】應(yīng)助回帖
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水稻白葉枯或者稻瘟病的抗性基因已經(jīng)有很多報(bào)道。稍微找一下就可以找到很多文獻(xiàn)的。 最簡(jiǎn)單的是到www.ricedata.cn上查找。里面有一欄“基因&QTL"，進(jìn)去以后，可以根據(jù)基因名稱、符號(hào)或登錄號(hào)進(jìn)行檢索。輸入Xa，點(diǎn)擊檢索，可以得到大部分的白葉枯病抗性基因，那些打勾的都是已經(jīng)克隆的基因，繼續(xù)點(diǎn)擊進(jìn)去就可以看到相關(guān)的基因符號(hào)和原始文獻(xiàn)。輸入Pi，點(diǎn)擊檢索，可以查到大部分的稻瘟病抗性基因。 至于您問(wèn)的問(wèn)題，實(shí)際上也沒(méi)有復(fù)雜。如果有相同大小的條帶，一般認(rèn)為是相同的allele。除非你知道那里有snp，才會(huì)去測(cè)序或者酶切驗(yàn)證其異同。 |
5樓2014-05-30 23:04:01
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6樓2014-05-30 23:08:35
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7樓2014-05-31 11:40:54
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