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jianchen7882金蟲 (小有名氣)
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[求助]
gromacs氫鍵分析工具，g_hbond輸出結(jié)果解析？ 已有1人參與
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| 如題，請(qǐng)教各位大神，g_hbond分析工具輸出的結(jié)果有三列，第一列是時(shí)間，后兩列是氫鍵數(shù)量，這里分析的是受體和配體拉伸時(shí)的氫鍵數(shù)量，請(qǐng)問為啥是兩列氫鍵數(shù)量啊？？ |
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水兒CoCo
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第一列是時(shí)間，第二列是氫鍵數(shù)目，第三列是pairs with 0.35 nm |
4樓2014-06-10 21:19:02
水兒CoCo
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【答案】應(yīng)助回帖
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| 得出的文件里最上面非數(shù)據(jù)那幾行里有寫明是什么，樓主注意打開來看看就知道了 |
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2樓2014-06-10 15:09:18
jianchen7882
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送紅花一朵 |
謝謝，輸出參數(shù)如下，具體解釋一下好嗎，謝謝��！1 # This file was created Mon May 26 20:35:37 2014 # by the following command: # g_hbond -f traj.xtc -s pull.tpr -num num.xvg # # g_hbond is part of G R O M A C S: # # GROningen Mixture of Alchemy and Childrens' Stories # "@ title ""Hydrogen Bonds""" "@ xaxis label ""Time (ps)""" "@ yaxis label ""Number""" @TYPE xy "@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85" @ legend on @ legend box on @ legend loctype view "@ legend 0.78, 0.8" @ legend length 2 "@ s0 legend ""Hydrogen bonds""" "@ s1 legend ""Pairs within 0.35 nm""" 0 1 3 1 1 3 2 2 1 3 4 3 4 3 1 5 2 5 6 3 1 7 3 2 8 3 1 9 3 1 |
3樓2014-06-10 20:35:47
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5樓2014-06-11 09:33:34
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