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austin2008鐵桿木蟲 (著名寫手)
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能在芽孢桿菌中復(fù)制的溫敏型復(fù)制子194ts片段連接T載體多次測(cè)序都發(fā)生突變 已有1人參與
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問題描述:本人想構(gòu)建一個(gè)溫敏型的穿梭質(zhì)粒,在NCBI上找到pE194質(zhì)粒上的復(fù)制子序列194ts(GenBank: M17811.1),然后送到蘇州某公司合成1138 bp 的片段,結(jié)果該公司兩次裝載pUC57載體失敗,主要是原因是,這個(gè)片段裝到pUC57載體中總是發(fā)生各種突變,他們測(cè)序了7個(gè)克隆子后測(cè)序發(fā)現(xiàn)2個(gè)雙峰,5個(gè)突變,而且每個(gè)突變的突變位置都不一樣,最終提供給我們的是合成的組裝好的PCR產(chǎn)物和空的pUC57載體,給我們的解釋是我們合成的194ts片段是個(gè)復(fù)制子可能會(huì)與載體上大腸桿菌的ori發(fā)生沖突,復(fù)制過程中產(chǎn)生突變。我當(dāng)時(shí)對(duì)這個(gè)解釋是將信將疑,等拿到材料了準(zhǔn)備驗(yàn)證一下,無論是我們連接pMD19T simple載體還是pUC57載體,做了3次,每次送3-4個(gè)陽性克隆子去測(cè)序,結(jié)果每次都有突變,而且每次突變的點(diǎn)不一樣,我們將這些突變的溫敏復(fù)制子酶切后,連入穿梭載體替換芽孢桿菌的復(fù)制區(qū)域,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化2次枯草芽孢桿菌,每一種都沒有長出陽性克隆子(注:對(duì)照質(zhì)粒轉(zhuǎn)化長了,枯草芽孢桿菌感受態(tài)細(xì)胞沒問題)。 我個(gè)人分析了一下,可能有以下2種原因:(1)這個(gè)溫敏型復(fù)制子194ts連入T載體質(zhì)粒不穩(wěn)定,可能是連入的方向不好;(2)大腸桿菌的ori和這個(gè)194ts片段在一個(gè)載體中時(shí)在質(zhì)粒復(fù)制過程中出現(xiàn)問題;問了好些做分子生物學(xué)的人都不知道其中出了什么問題,請(qǐng)了解情況的高手賜教,不勝感激……! |

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