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小錢不帥鐵桿木蟲 (正式寫手)
奮青
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[求助]
求大神幫助小弟構(gòu)建一下這個菌株序列的進(jìn)化樹 已有1人參與
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| 小弟本科畢業(yè)論文有菌株鑒定，可是系統(tǒng)進(jìn)化樹老是做的不理想，快要畢業(yè)答辯了，很急，求大神幫助，小弟在這里不勝感激。菌株名稱為BLy，序列如下：CCCCATTTGGCTTGCCTATACTGCAGTCGAGCGGACCGACGGGAGCTTGCTCCCTTAGGTCAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCTGTAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATGCTTGATTGAACCGCATGGTTCAATCATAAAAGGTGGCTTTTAGCTACCACTTACAGATGGACCCGCGGCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCGACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGTTTTCGGATCGTAAAACTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTACCGTTCGAATAGGGCGGCACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGGCGGTTTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCCCGGCTCAACCGGGGAGGGTCATTGGAAACTGGGGAACTTGAGTGCAGAAGAGGAGAGTGGAATTCCACGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATGTGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCTCTGGTCTGTAACTGACGCTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGCAGCAAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGACTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGACAACCCTAGAGATAGGGCTTCCTCTTCGGGGGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCG |
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【答案】應(yīng)助回帖
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小錢不帥(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+3, 鼓勵回帖交流 2014-06-19 09:12:44
小錢不帥(西門吹雪170代發(fā)): 金幣+3, 鼓勵回帖交流 2014-06-19 09:12:44
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樹不行很多原因，序列修剪的如何，用ncbi上blast的結(jié)果中的序列跑下試試，祝福！！要以后想學(xué)這個可以深入的學(xué)習(xí)下，有很多軟件要學(xué)，clustal，muscle比對序列，推薦幾種主流的建樹軟件paup，phyml，mrbayes，這幾種軟件基本滿足各種方法，mp，ml，bi的需要了，nj法在解決內(nèi)群關(guān)系上也不錯，不過是無根樹。mega都算了。。。只能呵呵兩字形容，最大的好處就是可視化強，能夠反映序列的基本信息，算遺傳距離什么的，做樹。。。呵呵。。。 |
4樓2014-06-17 14:11:55
2樓2014-06-17 08:21:20
小錢不帥
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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3樓2014-06-17 09:44:38
小錢不帥
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5樓2014-06-18 16:45:20
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