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happyzyf銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
VMD無法loadXDTCAR 已有1人參與
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我用vasp5.2進(jìn)行了MD計(jì)算，現(xiàn)在將POSCAR，CONTCAR和XDATCAR放在同一個(gè)文件夾中，用VMDload時(shí)顯示無法load，程序提示ERROR：file‘E:MGao/MD/1200K/XDATCAR’ does not contain all coordinates of the atoms. ERROR > molecule_structure: Unable to read structure 1 ERROR> molecule_structure:sever indicated by plugin aborting loading of molecule 1 不知道是不是沒有安裝插件的原因，我想用vmd做動(dòng)畫的，在網(wǎng)上看到有vasp plugins for VMD，是不是只有VMD還不能做動(dòng)畫啊。。。 煩請各位大俠幫助~~~ 圖片1.png 圖片2.png |
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xiaowenzhi16
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我用的是VASP5.3 XDATCAR顯示如下 unknown system 1 3.051048 0.000000 0.000000 0.000000 3.051048 0.000000 0.000000 0.000000 8.689464 N O Mg 2 2 4 Direct configuration= 1 0.50000000 0.00000000 0.62520081 0.00000000 0.50000000 0.37479919 0.00000000 0.50000000 0.87939497 0.50000000 0.00000000 0.12060503 0.50000000 0.00000000 0.87939842 0.00000000 0.50000000 0.12060158 0.00000000 0.50000000 0.62924788 0.50000000 0.00000000 0.37075212 Direct configuration= 2 0.50000000 0.00000000 0.62522550 1.00000000 0.50000000 0.37477450 0.00000000 0.50000000 0.87944467 0.50000000 0.00000000 0.12055533 0.50000000 0.00000000 0.87935303 1.00000000 0.50000000 0.12064697 1.00000000 0.50000000 0.62921269 0.50000000 1.00000000 0.37078731 Direct configuration= 3 0.50000000 1.00000000 0.62527636 0.00000000 0.50000000 0.37472364 0.00000000 0.50000000 0.87953701 0.50000000 1.00000000 0.12046299 0.50000000 0.00000000 0.87926510 0.00000000 0.50000000 0.12073490 0.00000000 0.50000000 0.62914416 0.50000000 0.00000000 0.37085584 Direct configuration= 4 不知如何改 |
7樓2014-08-19 10:00:53
銳利的碎片
木蟲 (正式寫手)
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2樓2014-06-21 07:23:24
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XDATCAR沒有問題。我又看了一下error的提示信息，最后說是“sever indicated by plugin aborting loading of molecule 1 ”缺少插件，不知道我都需要下載哪幾個(gè)插件，我看網(wǎng)上有說“System requirements Tutorials assume that following programs are installed on your system: VMD 1.8.3 or newer VASP plugins for VMD Movie generation tools : ImageMagick, netpbm and ffmpeg Rendering engines : POV-Ray, Raster3D Hardware accelerated OpenGL ”，其中“VASP plugins for VMD”里面沒說是什么插件。。。。。 |
3樓2014-06-21 16:38:43
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4樓2014-06-27 15:15:35
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