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pei小f

新蟲 (初入文壇)

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[求助] 初學(xué)gromacs，關(guān)于力場(chǎng)選擇和殘基出錯(cuò)問題的請(qǐng)教。

在VMD中對(duì)金屬氧化物NiO進(jìn)行了粗粒化，生成了pdb文件，然后想用gromacs中pdb2gmx命令將其轉(zhuǎn)化為gro，但是提示錯(cuò)誤如下：
Residue 'NiO' not found in residue topology database
我這個(gè)問題不是一般的生物大分子，比較特殊，該怎么解決？
還有，由于初學(xué)，對(duì)力場(chǎng)并不十分了解，所以該如何選擇適合我的問題的力場(chǎng)呢？
求大神指教�。。�！

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1樓 2014-07-02 08:52:06

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小許高年級(jí)

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MD小白

2樓2020-06-23 14:39:51

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