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luckydog52木蟲 (著名寫手)
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[求助]
染色質免疫共沉淀 中的 INPUT 和IP代表什么? 已有5人參與
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看文獻遇到染色質免疫共沉淀的圖,其中的INPUT 和IP是什么意思? 希望誰能簡單的解釋一下,謝謝 |

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至尊木蟲 (文壇精英)
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ChIP---染色質免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation assay)是目前唯一研究體內DNA與蛋白質相互作用的方法。 IP--免疫沉淀(immunoprecipitation),在CHIP試驗中主要有兩點意思:1)抗原蛋白質(靶蛋白,即所研究的目的基因編碼的蛋白質,一般是帶有標簽如GFP,MYC的融合蛋白)和抗體的特異性結合;2)細菌蛋白質的“prorein A”特異性地結合到免疫球蛋白,即抗體的FC片段,F在多用精制的prorein A預先結合固化在argarose的beads。 結合ChiP的具體操作步驟,甲醛處理細胞→收集細胞,超聲破碎,即得到核蛋白和DNA。從這里開始分兩部分,A部分不錯任何處理,作為Input;B部分加相應的抗體(根據你轉基因的標簽或者自己合成的靶蛋白的抗體),作為IP。加抗體,與靶蛋白-DNA復合物相互結合→加入ProteinA,結合抗體-靶蛋白-DNA復合物,并沉淀→解交聯,ProteinK消化蛋白,并提取DNA。同時也將Input的DNA提取出來。 IP下的DNA想對于INput的DNA肯定是很少的,IP/Input的比值就反應出目的蛋白結合DNA的量,這兩個的DNA含量是通過Real。裕椋恚濉。校茫抑械模茫灾祦沓尸F。 |

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