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richard0820銅蟲 (初入文壇)
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[求助]
崩潰。∫族e(cuò)pcr重組質(zhì)粒構(gòu)建總是失。!求大神指導(dǎo)! 已有3人參與
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小蟲做的是酶的定向進(jìn)化,主要是采用易錯(cuò)pcr技術(shù)實(shí)施目的片段的隨機(jī)突變,完了插入表達(dá)載體,表達(dá)蛋白測(cè)定性質(zhì)。 目前在構(gòu)建重組載體階段,可是構(gòu)建了一個(gè)月了就是不成功,老板又在催,心里那個(gè)急!具體情況是這樣的- 載體是我們實(shí)驗(yàn)室事先構(gòu)建好的pet-28a,含有目的片段,我要做的就是先用易錯(cuò)pcr把目的片段p出來(lái),主要是通過(guò)改變pcr體系中的各組分比例和濃度,然后純化,在和同樣的載體經(jīng)過(guò)雙酶切,連接,轉(zhuǎn)化。具體的體系: 雙酶切 用的是thermo scientic 的Nhel和Xhol,這兩種酶在同一緩沖液中活性不同,xhol在最適Nhel緩沖液中最大活性只有50%,我通過(guò)加倍用量進(jìn)行酶切,體系是1ug樣品加0.5ulNhel 1ulXhol,酶切5h,經(jīng)過(guò)單雙酶切驗(yàn)證,載體是切完全了的。 連接 用的是takara的t4連接酶,體系是按照說(shuō)明書來(lái)的,16 度過(guò)夜 酶切后都是經(jīng)過(guò)膠回收的,回收后濃度有50+ 轉(zhuǎn)化 轉(zhuǎn)的DH 設(shè)置了感受態(tài)空白對(duì)照,經(jīng)酶切膠回收后不加連接酶的空載,和連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化,轉(zhuǎn)化全部連接液25ul,操作沒(méi)問(wèn)題,以前做正常質(zhì)粒都是成功的,結(jié)果是感受態(tài)長(zhǎng)得好,空載不長(zhǎng),連接產(chǎn)物有時(shí)長(zhǎng)很多單克隆,有時(shí)就一兩個(gè),經(jīng)菌落pcr驗(yàn)證全是假陽(yáng)性,每個(gè)板挑了10個(gè)克隆。菌落pcr技術(shù)沒(méi)問(wèn)題。 問(wèn)題: 空載沒(méi)長(zhǎng),說(shuō)明幾乎沒(méi)有載體自連,實(shí)驗(yàn)板長(zhǎng)了有兩種情況:1 連接成功,那菌落pcr應(yīng)有條帶 2 連接不成功,載體又沒(méi)有自連,那哪來(lái)的克?? 好吧,就算不考慮空載對(duì)照,就算酶切不徹底,出現(xiàn)單酶切,載體自連了,但是我的載體本身是含有正常目的片段的啊,那應(yīng)該p的出來(lái)。?盡管沒(méi)有插入我需要的錯(cuò)誤片段。 為啥又出現(xiàn)克隆,又p不出條帶呢???整不明白? 求各位大神指導(dǎo)哇,感激不盡。! [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] [ Last edited by richard0820 on 2014-7-14 at 14:09 ] |
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (著名寫手)
| 有點(diǎn)不明白你說(shuō)的“結(jié)果是感受態(tài)長(zhǎng)得好,空載不長(zhǎng),連接產(chǎn)物有時(shí)長(zhǎng)很多單克隆,有時(shí)就一兩個(gè)”,意思是說(shuō)感受態(tài)空白對(duì)照長(zhǎng)了,加切膠回收但不連接的沒(méi)長(zhǎng),然后加鏈接產(chǎn)物長(zhǎng)得時(shí)好時(shí)壞?我猜想是不是你的板子的抗性出了問(wèn)題,并且使用的感受態(tài)細(xì)胞液有問(wèn)題。有重復(fù)過(guò)試驗(yàn)嗎?每次i都是這樣? |
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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