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yangcaoqing新蟲 (小有名氣)
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[求助]
MapQTL中l(wèi)oc文件的格式
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請問在多個linkage group的MapQTL分析中，loc文件的格式應該是什么樣子的呢？ 課題組的同事在前期的linkage Map構建過程中，linkage group是分開構建的，每一個group都有一個獨立的loc文件。然而在MapQTL中，需要把所有的linkage group放在一起分析，需要計算全基因組水平的LOD閾值。 現(xiàn)在我面前的問題是我可以把所有的linkage group放在一個map文件中，但是不清楚各個獨立的loc文件應該怎么處理，怎么分析呢？看了軟件自帶的樣本文件，愣是木有看懂啊�。�！每次用一個group的loc文件分析明顯不對，結果的峰圖中只有用到loc文件的那個group有峰圖，別的都因為singularity error沒有任何峰圖。坐等各位MapQTL高手解救，謝謝！ |
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2樓2014-08-02 18:18:26
yangcaoqing
新蟲 (小有名氣)
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3樓2014-08-05 14:47:47
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