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yangcaoqing新蟲 (小有名氣)
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[求助]
MapQTL中l(wèi)oc文件的格式
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請問在多個linkage group的MapQTL分析中，loc文件的格式應(yīng)該是什么樣子的呢？ 課題組的同事在前期的linkage Map構(gòu)建過程中，linkage group是分開構(gòu)建的，每一個group都有一個獨立的loc文件。然而在MapQTL中，需要把所有的linkage group放在一起分析，需要計算全基因組水平的LOD閾值。 現(xiàn)在我面前的問題是我可以把所有的linkage group放在一個map文件中，但是不清楚各個獨立的loc文件應(yīng)該怎么處理，怎么分析呢？看了軟件自帶的樣本文件，愣是木有看懂�。。�！每次用一個group的loc文件分析明顯不對，結(jié)果的峰圖中只有用到loc文件的那個group有峰圖，別的都因為singularity error沒有任何峰圖。坐等各位MapQTL高手解救，謝謝！ |
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yangcaoqing
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