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baoluolove銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
請問編程計(jì)算配位數(shù)時(shí)如何處理周期性邊界條件？ 已有1人參與
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| 自己按照老虎大王編程思路嘗試編程計(jì)算了配位數(shù)，可是發(fā)現(xiàn)和文獻(xiàn)有一定的出入，想想很有可能是沒有處理周期性邊界條件，請問專家們周期性邊界條件如何在編程中進(jìn)行處理的，十分感謝~ |
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Assuming the simulation box lengths along x,y,z directions are lx,ly,lz, you want to calculate the distance between particle i and j while removing the periodic boundary conditions This is what I did in Fortran xij = xi - xj - nint((xi-xj)/lx)*lx yij = yi - yj - nint((yi-yj)/ly)*ly zij = zi - zj - nint((zi-zj)/lz)*lz rij = sqrt(xij*xij + yij*yij + zij*zij) nint is a fortran function that gives the nearest integer of a real number. I'm sure you can find similar functions in C++ or other programing languages. |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
baoluolove3樓2014-07-12 00:58:19
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你好，我之前用你的這種方法計(jì)算配位數(shù)，實(shí)現(xiàn)了我的目標(biāo)，我現(xiàn)在同樣用你的這個(gè)轉(zhuǎn)換方法算鍵角分布函數(shù)，卻與沒用周期性邊界條件的結(jié)果是一樣的，你知道這是這怎么一回事嗎 |
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7樓2014-10-08 21:20:13
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