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baoluolove銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
請(qǐng)問編程計(jì)算配位數(shù)時(shí)如何處理周期性邊界條件？ 已有1人參與
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| 自己按照老虎大王編程思路嘗試編程計(jì)算了配位數(shù)，可是發(fā)現(xiàn)和文獻(xiàn)有一定的出入，想想很有可能是沒有處理周期性邊界條件，請(qǐng)問專家們周期性邊界條件如何在編程中進(jìn)行處理的，十分感謝~ |
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15216105346
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9樓2015-01-31 22:22:43
lsloneil
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【答案】應(yīng)助回帖
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baoluolove: 金幣+5, ★★★很有幫助 2014-07-12 08:39:37
baoluolove: 金幣+5, ★★★★★最佳答案, 已經(jīng)搞定啦~ 2014-07-12 09:40:07
月只藍(lán): 金幣+3, 應(yīng)助指數(shù)+1, 感謝指導(dǎo)！ 2014-07-16 16:34:48
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月只藍(lán): 金幣+3, 應(yīng)助指數(shù)+1, 感謝指導(dǎo)！ 2014-07-16 16:34:48
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Assuming the simulation box lengths along x,y,z directions are lx,ly,lz, you want to calculate the distance between particle i and j while removing the periodic boundary conditions This is what I did in Fortran xij = xi - xj - nint((xi-xj)/lx)*lx yij = yi - yj - nint((yi-yj)/ly)*ly zij = zi - zj - nint((zi-zj)/lz)*lz rij = sqrt(xij*xij + yij*yij + zij*zij) nint is a fortran function that gives the nearest integer of a real number. I'm sure you can find similar functions in C++ or other programing languages. |
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3樓2014-07-12 00:58:19
baoluolove
銅蟲 (小有名氣)
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4樓2014-07-12 08:38:44
ChemiAndy
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5樓2014-07-16 02:10:17
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