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zhang_jaj木蟲 (正式寫手)
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lammps文件原子屬性顯示問題-atomeye, OVITO, Pymol 已有1人參與
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因為計算完后獲取了atom幾種不同的屬性值，比如CNA，現(xiàn)在想按照這幾種值來顯示顏色。有幾個問題： 1. 用atomeye顯示這種屬性顏色是最方便的，但是問題是顏色方案不太好，總是調(diào)不到區(qū)分度較大的顏色。有個比較好的顯示rainbow方案，不過在一些期刊上又嫌這個顏色online版和print版的灰度值一樣（藍和紅）沒法區(qū)分。 2. 用OVITO顯示的顏色相對來說很好看，不過顏色方案貌似更少。只有jet，hot， grayscale和rainbow。而且我找了好久沒法調(diào)整顏色，不知道誰有比較好的方法嗎？并且這個軟件沒法讓atom周期平移來顯示想要的某個面的圖像嗎？只能通過切面嗎？還有這里能隱藏某些沒選擇了atom嗎，沒有找到。 3. 對于Pymol（顏色也很漂亮），如果想顯示不同的顏色，是只能按照之前的屬性編程把atom變成不同的元素名字并轉(zhuǎn)為pdb文件嗎？ |
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2樓2014-07-23 07:59:29
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zhang_jaj
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5樓2014-07-24 19:59:36
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